毋庸置疑，我国的科技体制改革已取得了显著成效，科技支撑引领经济社会发展的作用日益凸显；依靠创新驱动实现经济又好又快发展的战略思想深入人心。但是，又有许多事实充分说明科技与经济结合的问题尚未根本解决，科技成果难以转化为现实生产力的现象仍然困惑着我们。问题的症结究竟在哪？
解决科技与经济结合的问题始终是科技体制改革的核心。以往的改革从技术商品化、科技运行机制、组织结构、人事制度等方面采取了一系列措施。但主要是着力在微观组织层面，宏观管理层面的改革动作相对较少。改革进程发展到今天，需要更多地从宏观管理层面思考深化改革问题。换句话说，改革已经改到了推动科技体制改革的政府管理者自己头上。
中国改革的总取向是由计划经济转向市场经济，这就需要管理思维和模式做相应的转变。计划经济下的科技资源配置功能相对单纯，就是在大一统的社会发展计划下，实施具体的科技项目，实现计划规定的发展目标。而在市场经济体制下，政府科技资源的配置要基于市场经济机制的基础性调节作用，去更多地发挥对全社会科技发展的引导作用。除少数战略性、基础性、公益性项目需要政府直接配置资源组织实施外（即使这类项目也有运用市场机制问题，也不能完全沿用计划经济体制的做法），大多数科技资源配置作为政策工具，其功能在于调动社会的积极性，引导方方面面的科技资源，聚焦国家一个时期的科技发展目标。然而，目前科技资源配置基本上还是沿用了计划经济体制的做法，虽然增加了“发指南”、“招投标”等一些看似市场经济的做法，但实际上还是围着具体科技项目内容转，很少去考虑资源配置的政策目标是什么、如何去发挥引导社会资源的功能。管理者深陷“分钱、分项目”之中不能自拔。尽管有很好的促进科技与经济结合思路和指导思想，制定了很好的发展战略，但资源配置与改革脱节，体制机制难以提供实施保障。要改变这种状况首先要转变计划经济体制下的科技资源配置理念，在管理者中强化科技资源配置作为政策工具的意识，从根本上转变计划经济的思维模式，这才有可能发挥资源配置引导科技与经济结合的作用。
政府对科技活动管理的模式如何改变？
科学活动和技术活动有着密不可分的关联性，同时又有着各自不同的活动规律，要求着不同的管理方式。尤其是技术创新活动，以其延伸到经济领域为特点，有着自身的发展规律和管理要求。在计划经济体制下，政府科技管理部门按职能分工主要负责研发活动。目前政府对科技活动的管理模式基本上延续了计划经济体制的做法，仅仅按科研活动的规律，分研发阶段设置资源配置计划，并按大体相同的规则进行管理。从而忽视了技术活动中的集成要求，更忽视了技术创新活动对构建技术创新链的需要。研发活动获得了很多技术突破，但只形成了一个个技术“孤岛”，难以为生产所用，科研项目获得了很多技术“成果”，却难以转化为现实生产力。因此，如果政府科技管理部门的职能不再是只“管科研”而是要“管科技”，那么，对科技活动的管理模式不仅要遵循研发活动的规律，也要遵循技术创新活动的规律，需要从科学、技术、技术创新各自不同的规律出发，建立分类管理的模式，才有可能从根本上解决科技与经济结合问题。
政府管理科技活动的组织机构如何调整？
目前的状态是：在纵向上，按科研阶段设置；在横向上，按学科领域分工管理；大体形成了网状管理结构，基本覆盖了科技活动的方方面面。但是，这已不适应现代科学技术综合交叉发展的新趋势。在基础研究层面，学科分类相对清晰和简单，分管机构之间还比较容易协调学科综合交叉活动的管理问题。而在技术层面，技术综合交叉发展往往形成了新的技术领域，大大超出了原有的领域分工管理范围，出现了技术活动管理的真空，阻碍了新技术应用的速度。尤其是技术创新活动，它不仅有技术的综合交叉问题，更需要多种技术的集成，要求上下游技术的衔接和配套，形成系统的技术创新链，直接支撑原有产业的技术升级，或新兴产业的形成和发展，从而也要求跨学科、跨领域、跨技术活动阶段的管理。显然，现有的科技活动管理机构的设置依据与职责分工往往造成“铁路警察各管一段”状态，极不适应技术创新活动规律，而技术创新活动恰恰是科技与经济结合的最关键环节和最终体现。
以上三个问题相互关联，政府转变科技资源配置理念，才有可能解决“发展”与“改革”两张皮的问题，深化科技宏观管理改革，转变政府对科技活动的管理模式，调整管理科技活动的机构设置和职能，促进科技管理体制更加符合科学活动、技术活动和技术创新的规律，适应科技与经济紧密结合的要求。
