新一轮国有企业深化改革，必须以思想解放为前提，通过思想解放解决影响国有企业发展质量的认识和体制问题，推进国有企业现代化的进程。
首先，国有企业要成为独立的市场主体。国有的产权属性和国家利益的责任担当，决定了国有企业的政治属性，决定了它与一般企业在组织目标、资产管理方式上存在差异性。但是，社会主义市场经济条件下，在国内市场竞争和国际市场竞争的环境中，国有企业要生存和高质量发展，必须成为独立的市场主体。
国有企业能否真正成为独立的市场主体，取决于能否实现政企分开。政府要在解放思想的基础上，设计出既保持国有企业独立市场主体地位，又能发挥政府应该起的作用的方法。完善所有权与经营权分离的国有资本授权经营体制，是深化国有企业改革的重点所在。目前，一个似乎合理的做法是，国有资产监管机构以“监”为主，从法律上保护国家的利益，国有资本投资运营公司以“管”为主，保证国有资产保值增值，国有企业则具体负责企业运行。
但是，三者之间的权力是不等的、边界是不清的。前两者依次有较强的话语权和评判标准，后者则居于非平等、弱势的地位。要使国有企业真正成为独立的市场主体，必须在三者之间建立规范、平等、清晰的关系，划清权力和责任的边界。一个合理可行的办法是，建立层级之间对称的权力责任关系。国有资产监管机构对国有资本投资运营机构设立负面清单，国有资本投资运营机构对国有企业设立负面清单，无禁止则可行，谁行权谁担责。国有企业则在清晰的规则约束下成为独立的市场主体，按照市场规律进行自己的决策和企业运行。
其次，充分发挥国有企业企业家的作用。习近平总书记指出，坚持党对国有企业的领导是重大政治原则，必须一以贯之;建立现代企业制度是国有企业改革的方向，也必须一以贯之。两者之间很好地结合，才能保证在坚持正确的政治方向的同时，按照企业发展的一般规律形成合格的企业家队伍。
要明确划分两类企业家的性质和作用。一类是“企业领导人”，他们由上级政府委派，有“准公务人员”的属性，在国有企业实施党的领导和国有资本保值增值的职能。一类是技术类的管理者，他们具有企业管理的专门知识和能力，负责落实企业的发展战略、发现商机、组织队伍等企业经营的工作。减少有行政级别企业领导者的职数，将更多的企业管理者“去行政化”。国有企业党委书记(董事长)由上级政府派出，其它高级管理人员由职业市场产生。即使是上级委派的企业领导，也要注意其知识结构、工作经历的匹配性，且经过职业市场选择的环节。建立符合国有企业发展的“鼓励激励”“容错纠错”机制，明确企业经营绩效与企业领导者的收入挂钩，调动企业家的积极性和创造性。国有企业的管理要在合规的基础上，更大程度上通过强化企业法人治理结构，通过建立有效的监事会、独立董事和企业内部民主，实现内部管理决策的科学化，控制企业运行的风险。上级部门对国有企业的检查，不能照搬对行政部门的要求，要充分考虑企业工作的特点制定规则和要求。
最后，深化国有企业供给侧结构性改革。通过企业内部劳动人事关系的改革，形成企业内部待遇公平、竞争有序、以绩效决定员工收入和升迁的体制，充分调动员工特别是核心技术人员、管理人员的积极性，为高质量发展创造优质的人力资源基础。在企业内部去行政化。国有企业除极少数主要领导外，一律取消与公务员序列对接的行政级别，管理人员能上能下、能进能出，形成按市场竞争要求、按对企业贡献决定管理人员升迁的体制机制。国有企业要高质量发展，必须下决心解决企业内部“僵尸公司”问题。可以通过企业内部子公司之间的资产重组，或通过与非公有制企业、外资企业发展混合所有制经济的方式重组。对待实无价值的企业，则在稳妥安置相关人员的前提下进行破产清算或予以关闭。
