在1853年之前，日本天皇其实没有什么实权的，权利大多数都在幕府的手中掌握着。明治时期的德川幕府与天皇之前一直维持着一种非常微妙的平衡，直到1853年的黑川事件之后才发生了变化。尊王派为替天皇夺回权力，展开了打倒幕府的活动，这一活动以成功告终。但在过程中，有很多人死在了幕府手里，尊王派为纪念他们在各地建立了招魂社。
明治2年(1869年)，东京招魂社落成，五年后明治天皇首次前往拜祭。明治12年(1879年)，东京招魂社改名为靖国神社，待遇仅次于祭祀皇族的神社。加上天皇的祭拜，它在很长时间内都出于特殊地位，然而后来逐渐偏离成了军国主义教育基地。二战后，靖国神社供奉战犯的行为，更是令临近受害国家抗议加剧。
近代如此的情况，双方曾经又有过那样一段过往，所以很多人都认为靖国神社内不会有中国人。然而鲜为人知的是，靖国神社内，其实有三位中国人在内。首先第一位是老蒋，他在国内算是家喻户晓的人物，某种程度上来讲也应当算是日军的仇人。毕竟坚持抗战不投降，那为何会被供奉，还是被请进了靖国神社呢?
这源于他在战后所做的一个决定，根据数据显示来看，他在战后同意了至少120万战俘与140万平民的遣返。出于某种不可告人的密谋，就连冈村宁次都放过了，要知道这位可是中国战区最高司令官。冈村宁次跟那些甲级战犯相比，罪是丝毫不小的，甚至可以说是罪魁祸首类战犯。日本人觉得他这是“以德报怨”，为不忘大恩，将他供奉在靖国神社。
第二个是林净因，这位据说是林逋的后人，他将馒头带进了日本。1349年，林净因以俗家弟子的身份，跟随龙山德见抵达日本。最初定居在奈良，他很快发现日本的僧侣与中国的僧侣不同，中国僧侣一般食素。可日本的僧侣却是可以吃肉的，为了照顾到不能吃肉的僧侣，也是为了自己便制作了中国的菜馒头。
还将红豆熬成豆沙，做成甜馒头，很快馒头征服了日本人。当时日本的寺院又是上流社会的社交场所，因此馒头在一段时间中，还被作为皇室贡品。后村上天皇十分喜欢，高兴得将身边的宫女赐婚给了林净因，于是他在结婚的时候制作了红白两色的馒头送宾客。这一习俗后来成了日本人的习俗，直到现在，结婚或者喜事还有赠送红白馒头的习俗。
他的子孙继承了馒头事业，打出了盐濑馒头的招牌，织田信张、丰臣秀吉、德川家康等著名人物都是盐濑馒头的忠实追随者。现如今这品牌还在，只是店内的商品不光是馒头了，还有羊羹等物品。而林净因，也不光是靖国神社内供奉他，日本人还专门修建了一座馒头神供奉他。每年的4月19日，还会举办馒头节，都是为纪念林净因。
最后一位名声更大，不过呢，至今也没人能肯定他跟日本人的关系。这个人便是徐福，秦始皇手底下的一个方士，曾为秦始皇出海寻求长生不老药。最后一次出海的时候，他带了三千童男童女，结果一去不复返。这众多的随从与徐福本人，都再也没出现在中国历史上过，由于徐福是在东边出的海。
中国东边不远地方又是日本，便有人怀疑，他是直接定居在日本了。虽然说日本与中国的正史并没有这样的记载，不过民间传得很火热，还有人认为徐福以及他当初带去的日本遍布日本各地。甚至可以说是日本人的祖先，而在日本，有近三十个地方都有徐福的传说。事实上后来他到底去没去日本已经不重要了，后来的徐福更多的是渡来人的代表，是这一文化源头的象征。
