作为哥伦比亚的特有物种，马格达莱纳侧颈龟多分布于哥伦比亚内部，很少被其他国家引进。马格达莱纳侧颈龟在所有龟类当中属于中等体型，其背甲的长度最长能达45cm左右，由此可见其平均长度约保持在30~40cm之间，并不算大。马格达莱纳侧颈龟常常生活在南美洲的河流当中，沿岸人口密集，因此被人们观察和目击到的记录很多。
一、栖息环境遭到破坏
由于马格达莱纳侧颈龟是分布于南美洲，分布范围并不广泛，再加上其所赖以栖息的环境，由于人类的干预，栖息地遭到大规模的破坏，因此近年来关于马格达莱纳侧颈龟的记录以及研究正在慢慢减少。马格达莱纳侧颈龟主要分布在密西西比河流域附近以及一些淡水流域，无论是密西西比河还是其他河流，都是其所处国家发展农业以及工业最主要的用水来源。
为了给发展提供更多的能源，人们在密西西比河之上建立了许多水坝，同时还开辟了不少耕地，利用岸边的耕地资源发展农业以及工业，再加上大量污水排入流域内部，这使得马格达莱纳侧颈龟的生存环境遭到了破坏。由于其对所栖息环境的要求较高，也比较挑剔，短时间内无法找到更加适宜的环境，因此便只能灭绝。
二、调查资料很少
正是由于栖息地被破坏等这些因素的影响，才导致马格达莱纳侧颈龟的数量急剧减少。近年来关于它们的报道以及相关研究已经越来越少，本就神秘的它们因此更加罕见。马格达莱纳侧颈龟头部异常平滑，没有斑点，并且在嘴两旁长着长长的须。马格达莱纳侧颈龟的颜色比较单调，身体都呈灰色或棕色，看上去异常朴素。鉴于其在野外的数量急速锐减，生物学家们对它们的了解也越来越少，因此无法得知其具体的演化过程，这是十分令人惋惜的。
