人们对水晶骷髅头的神秘具有莫大的好奇心。在电影中这些水晶骷髅头是创造早期人类文明的外星人所留下的。虽然没有明显的证据可以来证明这些猜想，但是在Americas Honduras以及Mexico等地都出现过这种神秘的而水晶骷髅头的时候，人们再也坐不住了，这难道不是外星人留下的吗？那又会是谁呢？
带着这些疑虑研究人员将水晶骷髅头骨与曾预言过世界末日以及产生过许多文明的玛雅人和埃及法老所建造的不需要人热恋街舞就可屹立不倒的金字塔联系在一起，为什么呢？原来啊，这些水晶骷髅头看起来像是由一块完整的透明水晶做成，但上面由没有任何的人工制造痕迹，并且在制作的时候也没有考虑这块水晶的受力平衡以及是否会在制作的过程中破碎掉。
就算是目前最先进的工具也是无法制作的。研究人员在研究这块水晶骷髅头时还发现，这块头骨具有同水晶一样的分散光的功能，也就是棱镜作用（中国古人发现一些纯度较高的透明晶体具有分散光的作用，他们把这些高纯度的透明晶体又称为“五色石”。）
在十三颗水晶骷髅头中有一颗最有名气的水晶骷髅头骨。一九二四年，英国的著名作家F.A. Mitchell-Hedges死后将这块著名的水晶骷髅头骨给了自己的继女Anna Mitchell-Hedges，据传，这颗水晶骷髅头骨在三千六百年前就被人发现了，他的眼睛可以发射出蔚蓝色的光，如果将这颗高纯度的水晶骷髅头骨摆在电脑旁边，可致使计算机系统死机。
当然了，这些消息全由水晶骷髅头的主人所说，并没有现实依据，这是因为Anna Mitchell-Hedges不允许亵渎神圣的水晶骷髅头。
