虽然是分居，但是仍属于婚姻存续期间，是属于合法的夫妻，如果和他人恋爱仍算是出轨。
根据《民法典》（2021.1.1生效）第一千零四十三条：“家庭应当树立优良家风，弘扬家庭美德，重视家庭文明建设。夫妻应当互相忠实，互相尊重，互相关爱;家庭成员应当敬老爱幼，互相帮助，维护平等、和睦、文明的婚姻家庭关系。”的规定，以及结合我国一夫一妻制的基本制度，夫妻关系中只允许拥有一个配偶，分居后有外遇算出轨，因为违背了夫妻之间的忠诚义务。
我国的婚姻实行的是登记制度，也就是说即便夫妻已经分居，但是在法律上依然是夫妻关系。夫妻间的共同财产关系以婚姻关系的存在为基础，婚姻关系解除时，要对共同财产进行分割。对夫妻共同财产进行分割时，一般按照以下原则处理:
1、男女平等原则。
2、保护妇女、儿童的合法权益原则;
3、照顾无过错一方原则;
4、尊重当事人意愿原则。对夫妻双方有约定，且约定合法的，按约定处理。约定规避法律或者无效的，按共同财产处理;
5、有利生产、方便生活等原则处理。
所以，分居后有外遇导致夫妻关系破裂的一方在财产分割时出于劣势，也就是说会少分或者不分财产。
法律依据：
《民法典》第一千零八十七条 【离婚时夫妻共同财产的处理】离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理;协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。
对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。
二、出轨一方起诉离婚法院怎么判
1、法院会根据离婚诉讼案件的审理原则首先对双方进行调解，如果无过错方对过错方的过错给予谅解，过错方也也愿意接受调解，则双方存在调解的基础，法院会调解处理。
2、如果双方确实矛盾无法调和，或一方坚持要求离婚，则法院一般也会判决离婚。
3、法院在判决离婚时会根据实际情况给予无过错方一定的照顾。
4、无过错方也可以根据《民法典》第1091条的规定提出赔偿要求，具体的数额则要根据无过错方的损害程度(包括精神损害)双方的经济状况、当地生活水平等因素综合考虑。
《民法典》第一千零九十一条 【离婚损害赔偿】有下列情形之一，导致离婚的，无过错方有权请求损害赔偿：
(一)重婚;
(二)与他人同居;
(三)实施家庭暴力;
(四)虐待、遗弃家庭成员;
(五)有其他重大过错。
现实中，不管夫妻因为什么原因而分居，在分居期间其实双方并未解除婚姻关系，同时也不存在分居多长时间就可以自动离婚的说法，因此要是一方在分居期间与他人建立了恋爱关系的话，这是有可能构成出轨的。此时也要注意区分，与他人恋爱是属于精神出轨还是肉体上的出轨，就目前的情况来看，大部分人认为的出轨应该是属于肉体上的背叛。律图有在线律师，如果您有任何的疑惑，欢迎您随时咨询。
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