夫妻之间分居协议是可以进行公证的，但是并不是必须进行公证。分居协议原则上一经签字即为生效，但在现实生活中，很多当事人签订分居协议希望能以公证、律师见证等正规形式确认下来。实践中，几乎所有公证处都没有将分居协议明确列入民事协议公证的范围。
(1)规定双方的权利和义务。尤其要说明在分居期间，夫妻双方不再有义务与其丈夫或妻子同居。
(2)协议中要说明子女有谁抚养，抚养费如何承担以及探望权如何行使?
(3)可以对分居期间的财产进行约定，如无约定或无法达成协议，则仍视为夫妻共同财产。双方若同意，可以在协议中规定分居期间双方不再互相享有家事代理权(但无法对抗善意第三人)，如果一方违反则要赔偿另一方的损失。双方若同意，可以约定分居期间因为一方而产生的债务一律视为个人债务(同样无法对抗善意第三人)，一方如果违反要赔偿另一方的损失。
(4)分居的期限，应以三个月至两年为限，期限届满，如一方当事人依然认为感情无法复合而要求离婚的，可协议离婚或持该协议向法院起诉离婚。
三、分居的概念
分居，是指一家人分开生活;多指保留夫妻关系而不共同生活。分居不离婚，是美国夫妇现在很流行一种生活方式，这些人虽然觉得无法再以夫妻的身份继续生活，但鉴于各种各样的原因又不愿意舍弃婚姻带来的诸多好处，最后的结果就是两个人虽然在名义上还是夫妻，但实际生活中却是各过各的，互不干涉。
夫妻之间如果由于感情上的破裂不再选择共同居住的我们称之为分居，需要双方签订一份分居协议书，一经签字正式生效。至于是否需要公证在法律上并没有严格的要求，也就是说公证与不公证都是可以的，内容都受到法律的保护，双方也有义务对协议的内容积极履行。
