为了维护非婚生子女的合法权益，根据《最高人民法院关于确认非婚生子女生父中男方拒作亲子鉴定如何处理的答复》，在确认非婚生子女案件中，应当由原告承担举证责任，被告(男方)如果否认原告证明的结论，应提供相应的证据，若其不能证明自己不是非婚生子女的生父，法庭认为有必要的，可以要求其进行亲子鉴定。
如果被告拒绝作亲子鉴定的，法庭可以根据查证属实并排除第三人为非婚生子女生父的证据，推定原告的诉讼请求成立。实务中，非婚生子女案件中，女方主张男方承认非婚生子女并履行抚养义务的，需要承担《民事诉讼法》规定的举证义务。民事诉讼遵循的举证原则是“谁主张，谁举证”，女方在案件中所承担的义务主要有，提供初步证据证明男方是非婚生子女的生父。
二、亲子鉴定是不是可以随意启动
不是的。在离婚案件中一方拒绝进行亲子鉴定时，人民法院应当尊重当事人的选择。对于双方当事人同意作亲子鉴定的，一般应予准许;一方当事人要求作亲子鉴定的，或者子女已超过三周岁的，应视具体情况，从严掌握，对其中必须作亲子鉴定，也要做好当事人及有关人员的思想工作。
三、法院对亲子关系具体会怎样进行推定
《婚姻法》若解释(三)就规定了两种情况下如何推定亲子关系。该司法解释第二条规定：夫妻一方向人民法院起诉请求确认亲子关系不存在，并已提供必要证据予以证明，另一方没有相反证据又拒绝做亲子鉴定的，人民法院可以推定请求确认亲子关系不存在一方的主张成立;
当事人一方起诉请求确认亲子关系，并提供必要证据予以证明，另一方没有相反证据又拒绝做亲子鉴定的，人民法院可以推定请求确认亲子关系一方的主张成立。
