子女抚养费的支付最好由夫妻双方协商解决。在夫妻发生分居前或分居后，双方可以通过各种联系方式，比如电话、短信、电子邮件等，对孩子抚养费的支付进行协商。协商的内容主要包括另一方需要支付多少抚养费、在什么时间支付、以什么方式支付。夫妻协商解决抚养费的好处是可以减少对孩子的伤害，毕竟抚养费的最终受益者是孩子。在协商解决分居支付孩子抚养费问题时，夫妻双方最好将抚养费支付协议予以公证，防止以后发生纠纷。
如果夫妻双方不能通过协商方式解决分居期间孩子抚养费问题的话，那么可以向法院起诉解决。法院会根据双方的经济状况、当地的生活水平等因素，确定一个对孩子成长最为有利的抚养费金额，并且对抚养费的支付时间和方式作出判决。当夫妻一方不履行法院关于分居支付孩子抚养费的判决时，另一方可以申请法院强制执行。
《民法典》(于2021年1月1日生效)第一千零六十七条父母不履行抚养义务的，未成年子女或者不能独立生活的成年子女，有要求父母给付抚养费的权利。
二、抚养费数额
关于抚养费的数额，最高人民法院《关于人民法院审理离婚案件处理子女抚养问题的若干具体意见》第7条作了具体规定，即根据子女的实际需要、父母双方的负担能力和当地的实际生活水平确定。有固定收入的，抚养费一般可按其月总收入的百分之二十至三十的比例给付。
无固定收入的，抚养费的数额可依据当年总收入或同行业平均收入，参照上述比例确定。有特殊情况的，可适当提高或降低上述比例。
子女抚养费的支付不因夫妻关系的存续和破裂而中断，因此分居期间仍需负责子女的抚养费，具体支付多少夫妻可商议，不能达成统一意见的可走法律程序，诉讼解决。法院会视情况判决，有稳定收入的，一般按月收入20%到30%支付抚养费。
