合作医疗一般是到乡镇的民政部门去办理。合作医疗需要拿着户口册和身份证，带上两张照片，到户口所在地的基层民政部门医保办办理。新型农村医疗合作制度的基金采取专户存储，专款专用的方式，严禁任何单位和个人违法挪用。参加合作医疗的农民到县(市)、乡(镇)、村定点医疗机构就诊时，可直接按规定减免或报销部分医药费用。
《中华人民共和国社会保险法》第二十三条
职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。 无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。
延伸阅读：
农村合作医疗怎么报销
怎么查合作医疗交没交
报了合作医疗还能工伤认定吗？
