犯本罪，处三年以下有期徒刑或者拘役。
根据《刑法》第285条的规定，违反国家规定，故意侵入国家事务、国防建设、尖端科学技领域的计算机信息系统的，应当立案。
本罪是行为犯，只要行为人违反国家规定，故意实施了侵入国家事务、国防建设、尖端科学技术领域计算机信息系统的行为，原则上就构成犯罪，应当立案追究。
1、客体要件
计算机信息系统是指由计算机及其相关的和配套的设备、设施(含网络)构成的，按照一定的应用目标和规则对信息进行采集、加工、存储、传输、检索等处埋的人机系统。
在国家事务管埋、国防、经济建设、尖端科学技术领域都广泛建立了计算机信息系统，特别是在关系到国计民生的民航、电力、铁路、银行或者其他经济管理、政府办公、军事指挥控制、科研等拧领域。这些汁算机信息系统的正常运行、对于保障国家安全、经济发展和保护人民生命财产安全等方面都起着十分重要的作用。
2、客观要件
本罪在客观方面表现为行为人实施了违反国家规定侵入国家重要计算机信息系统的行为。
3、主体要件
本罪的主体是一般主体。本罪的主体往往具有相当高的计算机专业知识和娴熟的计算机操作技能，有的是计算机程序设计人员，有的是计算机管理、操作、维护保养人员。
4、主观要件
本罪在主观方面是故意。即行为人明知自己的行为违反国家规定会产生非法侵入国家重要计算机信息系统的危害结果，而希望这种结果发生。过失侵入国家重要的计算机信息系统的，不构成本罪。
非法入侵计算机系统罪的准确说法应该是非法侵入计算机信息系统罪，这也属于扰乱公共秩序犯罪中的一种。当然在判断是否构成此罪的时候，还是需要看是否满足了规定的立案标准，不满足自然就不能认定构成此罪，而之后也不可以追究行为人的刑事责任。
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