笔迹鉴定结果是可以确认无效的，如果确实存在结果是违法或者和事实完全背离就可以申请要求重新再检查一遍，如果第二遍的结果相矛盾就要确认第一次的结果是无效的。
但是如果因鉴定结论错误不服而要推翻，则一定要坚持申请重新鉴定。那么取得法官对重新鉴定的支持就是首要目的。当事人就不能单纯的只是提出申请，而要围绕重新鉴定申请准备充分合理的理由，要尽量搜集证据，要尽其所能。比如对鉴定结论提出充分有据合法合理的异议，包括针对鉴定程序和鉴定结果等等。
二、关于笔记鉴定的相关规定有哪些?
1、这方面，可以参考的法律依据为最高人民法院《关于民事诉讼证据的若干规定》第27条规定“当事人对人民法院委托的鉴定部门作出的鉴定结论有异议申请重新鉴定，提出证据证明存在下列情形之一的，人民法院应当准许：
(二) 鉴定程序严重违法的;
(四) 经过质证认定不能作为证据使用的其他情形”内容，以及第28条规定“一方当事人自行委托有关部门作出的鉴定结论，另一方当事人有证据足以反驳，并申请重新鉴定的，人民法院应予准许”等内容。
2、但 “何谓“鉴定程序严重违法”、“鉴定结论明显依据不足”、“经过质证认定不能作为证据使用的其他情形”、“有证据足以反驳”并无明确和具体的标准。
3、所以就大有文章可做，完全在于当事人自己的努力了。聘请专业律师就显得尤为重要。
4、比如，有些当事人在提出重新鉴定申请后并不能提出充分的理由，或者提出了充分的理由而法官并不支持。
5、那么可能最终会放弃重新鉴定申请，或者无奈得同意不满意的鉴定结论。很多当事人不懂得可以利用依法申请法官回避或者投诉的手段来达到重新鉴定的目的。
6、向司法行政机关投诉反映，以达到撤销违法司法鉴定结论的目的。
7、如果司法鉴定机构违法违纪进行司法鉴定活动，则可以向省级司法行政部门投诉。司法行政部门可以对其违法行为进行调查和处理从而使得原鉴定结论作废或者司法鉴定结构主动撤销违法的鉴定结论。
8、当前的司法鉴定实践中，鉴定机构作为商业主体很多都存在委托受理把关不严，鉴定结论草率，鉴定程序不规范，鉴定暗箱操作及受贿腐败的问题。所以投诉举报司法鉴定机构违法行为的方式也是可以考虑选择的。
想要进行笔记鉴定，第一，笔记鉴定的人员要有一定的鉴定资格，必须是国家承认的。而且，鉴定程序不能违法。如果鉴定的证据不足，或者是不能当所鉴定的依据，那么笔记鉴定就可以定为无效。如果当事人有异议，可以向司法机关投诉。
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