1、DNA提取
把样本细胞核中所含有DNA提取出来，然后进行一定的纯化，化除样本中的杂质。
2、PCR扩增
PCR的中文名为聚合酶链式反应，简单的说，PCR扩增这一步就是把所需要的片段通过酶促反应，在PCR仪上进行大量复制，放大到通过某些专用仪器可以看到的程度。
3、后PCR反应
这一步主要是上生物系统测序仪检测的准备阶段，将双链的DNA打开，加一些检测用的的内标，主要是用来标记检测的片段长度。
4、毛细管测序仪检测
由于DNA带有电荷，通过毛细管电泳的方法，不同片段DNA长度的电泳速度不同，在同样的电压，同样的电泳时间下，泳动的距离不同，这些长短不同距离可以通过前期加入的内标测量分辨出来，同时可通过一定的软件显示在电脑上，方便检测人员处理和分析数据。
5、分析数据，出具报告
主要是检测人员将所得结果进行分析汇总、计算，然后出鉴定结论和报告。
(一)刑事案件方面
1、强奸致孕，需要确定犯罪嫌疑人;
2、高度腐败的无名尸体或骸骨，需要确定身份的;
4、交通事故致死，亲属需要认领尸体并得应有赔偿。
(二)民事案件方面
1、办理移民;
2、子女户口登记;
3、财产继承纠纷;
4、怀疑婴儿被调换;
5、超生子女的血缘鉴定;
6、非婚生子女的血缘鉴定;
7、失散子女的血缘鉴定;
8、男子想证实孩子是否亲生;
9、被领养的孩子寻找亲生父母;
10、帮助寻找失散的家庭成员;
11、帮助妇女从孩子生父处获得子女抚养费用;
12、帮助父母亲取得亲生子女的监护权和探视权;
13、试管婴儿的血缘鉴定，鉴别经体外授精获得的试管婴儿有无实验室的差错;
交通事故致死亲属认领尸体、强奸致孕需要确定犯罪嫌疑人等的情形都有可能需要做亲子鉴定。做鉴定的时候需要的材料包括被鉴定人的身份证、被鉴定人的血样等。通常来说，被鉴定人不会少于二人。
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