虚开发票案件中，一般由税务机关发现初步线索，没有货物购销或者没有提供或接受应税劳务而为他人、为自己、让他人为自己、介绍他人开具增值税专用发票。确定符合刑事立案标准后，移交公安机关处理；公安机关经立案、侦查、终结后，移送检察机关审查起诉；检察机关经审查后，向人民法院提起公诉。
新的《刑法》第三章第六节危害税收征管罪中有妨害发票管理的犯罪。依据《刑法》第二百零五条规定，犯虚开增值税专用发票、用于骗取出口退税、抵扣税款发票罪的，处3年以下有期徒刑或者拘役，并处2万以上20万以下的罚金;虚开的数额较大或有其他严重情节的，处3年以上10年以下的有期徒刑，并处5万以上50万以下的罚金。
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