一是担保的债权数量不同。一般抵押权担保的为一个债权，而最高额抵押权担保的债权的数量是不确定的，可能是一个债权，也可能是多个债权，但一般是多个债权。
二所担保债权发生时间不同。一般抵押权担保的为一个时间点发生的债权，而最高额抵押权担保的为一段时间内连续发生的债权。
三是在设立时，确定的担保内容不同。一般抵押权设立时，其担保的债权已经发生，因此担保的金额等都已经确定，而最高额抵押权担保的是将来发生的债权，其设立时，其担保的债权尚未发生，因此其所担保的债权的实际金额、债权发生的次数等都尚未确定，确定的只是所担保债权的最高限额。
四是在转移上，一般抵押权要求债权转移的，抵押权也随之转移;但在最高额抵押权中，根据《中华人民共和国民法典》第一条因不动产物权的归属，以及作为不动产物权登记基础的买卖、赠与、抵押等产生争议，当事人提起民事诉讼的，应当依法受理。当事人已经在行政诉讼中申请一并解决上述民事争议，且人民法院一并审理的除外。
五是在消灭上，一般抵押权要求主债权消灭的，抵押权也消灭;但在最高额抵押权中，只要产生最高额抵押权的基础关系还存在，部分债权的消灭不影响最高额抵押权的存在。
六是最高额抵押与一般抵押相比更适应商品经济的发展。例如，甲向银行连续多次借款，如果采用一般抵押的办法，那么每次借款都要设定一个抵押担保，签订一次抵押合同，进行一次抵押登记，手续十分繁琐，而在借款之前设定一个最高额抵押，无论将来债权发生几次，只要签订一个抵押合同、作一次抵押登记就可以了，这样做既省时、省力、省钱，还可以加速资金的融通，促进经济发展。
一是申请时，当事人有可能无法提供主债权债务合同，因为所需要担保的债权尚未发生，但是当事人应当提供最高额抵押合同。
二是审查时，注意审查当事人提交的最高额抵押合同是否对所担保的最高债权额以及最高额抵押的期间等作出约定，所担保的最高债权额是否超过所抵押的土地价值，最高额抵押的期间是否超过所抵押土地的剩余使用年限等(如果所担保的最高债权额超过所抵押土地价值，则抵押权人只能就所抵押土地的价值优先受偿，如果最高额抵押的期间超过所抵押土地的剩余使用年限，抵押权在所抵押土地的剩余使用年限届满后就自动消灭，但都不影响抵押登记，这些是抵押权人应当注意的风险)。
三是注册登记时，应当在土地权利证书(包括当事人提交的土地使用证以及将要发放给当事人的他项权利证明书)和土地登记簿上应当记载权利类型为最高额抵押权，并记载所担保的最高债权额以及最高额抵押期间。由于所担保的债权尚未发生，无法确定债权和抵押权的期限，因此土地他项权利证书书上的“存续期限”一栏可以不填写。
四是注册登记后，最高额抵押的期间届满并不表明抵押权期限届满，更不表明抵押权消灭，登记机构不得自行注销最高额抵押登记。
五是注册登记后，当事人就所抵押的土地价值高于所担保最高债权额的余额部分再次抵押申请登记的，登记机关应当受理，只不过应当在“权利顺序”栏注明所设立抵押权的顺序。
在司法实践中，是申请最高额抵押还是一般抵押，应由当事人根据实际需要确定。两者的程序是一样的。一般需要向担保机构提交申请及相关材料。担保机构审核相关信息后，符合相关条件的即可办理。
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