申请双方确认合同不成立可以通过诉讼方式。合同的不成立，有以下几种情形：
1、一人自行订立合同;
2、当事人之间订立合同的意思表示不一致，未形成要约、承诺的合致;
3、合同的客体不确定;
4、要物合同未履行物的给付;
6、法律规定或者是当事人约定采用书面形式订立合同，当事人未订立书面合同且未履行的。
《民法典》第一百四十三条 【民事法律行为有效的条件】具备下列条件的民事法律行为有效：
(一)行为人具有相应的民事行为能力;
(二)意思表示真实;
(三)不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
(一)两者的法律含义不同。
无效合同是指因不符合或违反法律要求的、不能发生当事人预期的法律后果的合同。无效合同是法律禁止订立的合同，它不能得到法律的承认和保护，不能对当事人产生法律约束力。
不成立合同是形式不符合法律规定的合同，无效合同是本质不符合法律规定的合同，两者强调的内容不一样，不成立合同强调的是程序内容不合法，无效合同强调的是实体内容不合法。
(二)两者形成的法律关系不同。
不成立合同当事人之间已形成的是缔约关系。尽管当事人未形成合同法律关系，但不等于相互之间没有任何权利义务。因为此时当事人开始着手实施订立合同的民事活动，订立合同的当事人在协商时，必须尽到善意、互相协助、及时通知等义务，必须依交易惯例办事，这些义务在理论上称为附随义务或称先合同义务的义务。
而无效合同的当事人已完成了合同订立的程序，双方已形成合同关系，只不过无效合同是国家法律禁止订立的合同，合同的内容得不到法律的承认和保护，不能产生法律约束力而已。此外，当事人的缔约关系已消灭，因为此时合同已成立，当事人在缔约阶段的权利义务已完成。
(三)两者形成的原因不同。
从不成立合同的概念可以推断出不成立合同形成的原因有三种：合同的主要条款不具备;当事人的意思表示不一致;合同的形式不合法。
无效合同产生的原因有：一是合同主体不合格，当事人不具备订立合同的行为能力;二是当事人的意思表示不真实;三是合同的内容不合法，其内容违反法律强制性或禁止性规定，违反公共秩序或社会公共利益。
在我们的现实生活当中，现在如果要确认合同不成立的话，是可以通过诉讼的方式的，毕竟人民法院所作出的生效判决，如果对方不承认不同意的情况之下，是可以通过强制执行的方式来予以强制执行。从从从这种程度上来看的话，也就意味着法院诉讼方式有一定的强制力度的。
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