一，工程款未能及时付款违约金是否会受到有关部门的处罚
1、根据《最高人民法院关于逾期付款违约金应当按照何种标准计算问题的批复》，对于合同当事人没有约定逾期还款或付款违约金标准的，可以要求违约金，该违约金可以参照中国人民银行规定的金融机构计收逾期贷款利息的标准计算。
2、违约金计算方式(即逾期贷款利息计算方式)：在借款合同载明的贷款利率水平上加收30%-50%，但不得超过中国人民银行贷款利率的4倍。若未约定贷款利率的，在中国人民银行发布的同期贷款利率的水平上加收30%-50%。(依据中国人民银行关于人民币贷款利率有关问题的通知)
二，逾期付款违约金和欠款利息的概念
所谓“违约金”，顾名思义，是指合同一方违反合同的约定，而应向合同相对方支付的一定金额。其存在的前提是合同对此有约定。逾期付款违约金就是合同双方约定当一方不按期履行其付款义务时，应向另一方支付的违约金。
欠款利息，是指一方有向另一方支付一定金钱的义务，而其并未履行这个义务，另一方有权在向其主张支付本金时，同时主张本金延付期间的利息。
由上可知，原告主张逾期付款违约金，必须有合同约定，而主张欠款利息，则不一定有合同的约定，甚至不一定是合同纠纷，只要能够证明存在欠款的事实即可。
三，当事人在合同中约定款项支付的不同情形
1、当事人既约定了支付款项的时间，也约定了逾期支付款项应承担的违约金或支付利息的标准或数额;
2、当事人约定了支付款项的时间，也约定了逾期支付款项应承担违约金或支付利息，但未约定违约金或利息的计算方法或数额;
3、当事人约定了支付款项的时间，但未约定逾期支付款项是否应承担违约金或支付利息;
4、当事人对支付款项的时间未作约定或约定不明确。
四，原告一般会列出的几种诉讼请求模式
3、在请求对方支付款项本金时，既请求支付逾期付款违约金，政府工程欠款。又请求支付利息;
4、在请求对方支付款项本金时，同时请求赔偿利息损失。
违约金的处置在商业活动中是自己权益的保障，毕竟时间对于工程来说有着重要的意义，因此在具体问题的处理上需要自己学会合理的寻找相关的法律条例，这样问题的解决就会有着充分的法律基础，对于程序上的漏洞，有关的当事人可以获取更多支持。
延伸阅读：
工程施工合同违约金比例规定是什么？
合同违约金最高限额
租房未到期违约金怎么计算？
