税收风险是指企业在遵从税法时的实际表现与应该达到的实际标准之间存在差异进而导致损失的不确定性。主要分为三大类：
经营行为适用税法不准确造成企业应享受而未享受相关税收优惠政策、错误适用税率多缴税款或应抵扣未抵扣进项税金等，使企业承担不必要的税收负担和经济损失，并直接影响利润总额。
企业的纳税行为不符合税收法律法规的规定，应缴税而未缴税、少缴税或未能准确界定增值税进项税的抵扣范围或违规操作抵扣，均存在被税务机关查处后补缴税款，加处罚款和滞纳金以及声誉损害等风险。
3、发票管理风险。
企业最大的发票管理风险是虚开发票风险。由于增值税专用发票具有抵扣税款的功能，因此虚开增值税专用发票不仅是发票管理办法和增值税专用发票使用规定严厉禁止的行为，也是刑法要严惩的犯罪行为。企业发票管理不善，就可能出现虚开发票或取得虚开发票的情况，从而带来违法犯罪风险及多缴税款的风险。
