（一）清算过程中：流转税、其他相关税种；
（二）确定清算所得后：企业所得税；
企业的清算所得，为全部资产可变现价值或交易价格，减除资产的计税基础、清算费用、相关税费，加上债务清偿损益等后的余额。清算企业确定清算所得后，应计算并缴纳清算所得税。
（三）向股东分配剩余资产，股东还要交个人所得税；
（四）房屋租赁税补交；
房产税是所有企业都要交，不交房产税，房租费用不能进账，后期查账要补交，严重的要罚款滞纳金。所以在注销公司时最好查询一下，看其是否交过房屋租赁税，如果没有就需要补交，以租金收入12%计算缴纳。
（五）实收资本印花税；
（六）账本印花税；
（七）各类欠税和罚款。
根据《中华人民共和国公司法》规定，注销公司依法依照：依法成立清算组；公告并通知债权人申报债权，依法对债权进行登记；清算组接管公司，展开清算工作；清算组全面清理公司财产、编制资产负债表和财产清单；
制定清算方案，并报股东会、股东大会或者人民法院确认，根据股东会、股东大会或者人民法院确认的清算方案分配公司财产；制作清算报告，报股东会、股东大会或者人民法院确认后，申请注销公司登记，这些步骤才能够办理注销登记。
所以公司注销前必须经过税务检查，检查无问题才能注销税务登记，如果要补交税，肯定是税务检查有问题。
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