1、作品反映的意志不同：
职务作品是职务作品的作者个人思想或情感的反映。职务作品归根到底是作者个人意志体现。
2.单位在创作过程中发挥的作用不同：
就职务作品来说，单位一般只提供物质技术条件，对作品的进度、如何进行等过程和细节往往不予关注过多;创作过程中，职务作品的创作者享有很大的自主权，其完全可以根据自己的意志和想法完成作品，只要最后完成了单位交给的工作任务即可。而法人作品的创作过程，一般情况下单位是会全程关注甚至介入的;单位要在实施过程中发挥主持者和组织者的角色，并代表单位的意志进行创作，创作过程中出现的任何偏差和动向，单位都会有所掌握并作出相应的决断。
3.对作品享有权利的程度不同。
单位对于法人作品倾注了较多的精力，相应地就一定程度上减轻了作者的负担，因此，对于法人作品，单位应该享有充分的权利，应包括占有、使用、收益和处分在内的权利。而职务作品则是作者在创意和创作中发挥主要作用，单位只是提供了物质技术条件方面的客观帮助和便利，因此，作者应享有大部分的权利，单位只享有优先使用权等部分权利(当然，著作权法规定的特殊情况除外)。
4.作品责任的承担主体不同。
简而言之，如果一部作品在性质上究竟是职务作品还是法人作品，其中的关键判断因素是看该争议作品由谁承担作品责任，如果该作品责任由作者承担，则应该是职务作品;如果作品责任全部由单位来承担，则是法人作品。当然，这里的作品责任，应指作品本身所可能涵盖的所有责任，包括但不限于法律责任、政治责任、道德责任等等。
综上，法人作品和职务作品在表面上看都是由某个组织提供资源给发明者，并由发明者完成相应的作品，但是因为这个组织所处的地位和作用不同，也导致了其与作者之间的关系也会发生变化，比如职务作品与作者的关系没有法人作品密切。
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