一、自然人商标侵权如何处罚
对于侵犯注册商标专用权的，依据《商标法》第五十三条、《商标法实施细则》第四十三条规定，工商行政管理机关可以采取下列措施给以处罚。
(1)责令停止侵权
具体措施如下：
① 责令立即停止销售;
② 没收、销毁侵权商品;
③ 没收、销毁专门用于制造侵权商品、伪造注册商标标识的工具。
(2)处以罚款
对侵犯注册商标专用权但尚未构成犯罪的，工商行政管理机关可以根据情节处以非法经营额50%以下或侵权所获利润五倍以下的罚款;对侵权单位的直接责任人员，可根据情节处以1万元以下罚款。
对以上两项处理不服的，当事人可以收到通知之日起15天内依照《中华人民共和国行政诉讼法》向人民法院起诉。逾期不起诉又不履行的，由工商管理机关申请人民法院强制执行。
(3)就侵犯商标专用权的赔偿数额进行调解
进行处理的工商行政管理部门根据当事人的请求，可就侵犯商标专用权的赔偿数额进行调解，调解不成的，当事人可依法向人民法院起诉。
二、商标侵权怎么处理
首先，要注意对证据的收集。只有在证据充足的情况下，才有利行政执法机关或司法审判机关对某一行为是否是侵权行为尽快的加以认定。因此证据是影响案件办理的前提条件。证据主要包括：
1、被侵权人的在先权利证明文件。
2、被侵权人的产品样本。
3、侵权产品样本。
4、购买侵权产品的证明。这里主要是指购买发票。在发票上一定要注明，侵权产品名称、购买侵权产品的地点、侵权产品的价格、销售人的名称等事项。
第二，我们在对证据进行了初步的收集整理后，应该到专业的代理机构进行咨询。对侵权案件的处理大体上有两种途径。行政查处和诉讼程序。
第三，制作投诉书或起诉书。投诉书或起诉书的制作要注意将事实和语气有效的结合在一起，以利于案件的顺利进行。
商标的注册就是为了保护商标所有人的权利不受侵犯，并且任何人未经权利人同意都不得使用其商标，若使用了权利人可以要求工商行政管理机关给以处罚等。因此，当事人可就侵犯商标专用权的赔偿数额进行调解。
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