(一)专利和商业秘密的产生方式不同。专利必须通过申请，由国家授权后，才受到法律保护。商业秘密，则不需申请，更无须授权。权利人只要对其尚未公开的技术采取了保密措施，商业秘密便随即产生。
(二)专利和商业秘密的财产权性质不同。专利是一种完全的财产权，它具有独占性，谁首先申请专利并得到批准，谁就对这项技术享有专有权。未经专利人许可，其他人都不得使用。商业秘密的权利人则不具备这种独占性，商业秘密也不是一种完全的财产权，只要不是采用不正当手段获取的，同一项商业秘密，可以有若干权利人同时享有。
(三)专利和商业秘密受保护的时限不同。专利权的保护是有时间限制的，根据《专利法》的规定，发明专利权的期限为20年，实用新型专利权和外观设计专利权的期限为10年。专利保护期限届满后，该项技术不再受法律保护。商业秘密的保护是没有时间限制的，只要不被泄露或由权利人自行公开，可以一直受到法律的保护。
(四)专利和商业秘密的保护方式也不同。 专利是通过技术公开和限制使用的方式对专利技术实施法律保护的。商业秘密则是通过采取保密措施，严格控制知悉范围的方式对专有技术实施保护的。由于保护的方式不同，商业秘密与专利权适用的范围也有所区别。
二、商业秘密的三个特性是什么?
1、非公开性
商业秘密的前提是不为公众所知悉，而其他知识产权都是公开的，对专利权甚至有公开到相当程度的要求。
2、非排他性
商业秘密是一项相对的权利。商业秘密的专有性不是绝对的，不具有排他性。如果其他人以合法方式取得了同一内容的商业秘密，他们就和第一个人有着同样的地位。商业秘密的拥有者既不能阻止在他之前已经开发掌握该信息的人使用、转让该信息，也不能阻止在他之后开发掌握该信息的人使用、转让该信息。
3、利益相关
能使经营者获得利益，获得竞争优势，或具有潜在的商业利益。
专利目前就只有发明专利，实用新型专利和外观设计专利三种类型，而且专利是必须要到国家专利局进行申请的，授予专利权以后才拥有专利权，可是商业秘密不需要经过国家有关部门的批准。
延伸阅读：
商业秘密的法律保护
侵犯商业秘密罪的特征
商业秘密的构成要件是什么
