一、综合计算工时加班费应该怎么计算?
1、综合计算工时工作制休息日安排劳动者工作的，应先按同等时间安排其补休，法定节假日不可以补休。
2、综合计算工时工作制周期内的上班是在法定休假日的，以300%计算。
3、综合计算工时工作制周期内的总上班时间超过该周内(如一个月、一季度)的法定标准工作时间的，以超过部分的时间总数一起计算(不区分是否在休息日)，以150%计算。
4、延长工作时间的小时数平均每月不得超过36小时，超过36小时的，加班费计算应仍以以150%计算。
二、一般情形下加班费的发放规定
《工资支付暂行规定》
第十三条 用人单位在劳动者完成劳动定额或规定的工作任务后，根据实际需要安排劳动者在法定标准工作时间以外工作的，应按以下标准支付工资：
(1)用人单位依法安排劳动者在日法定标准工作时间以外延长工作时间的，按照不低于劳动合同规定的劳动者本人小时工资标准的150%支付劳动者工资;
(2)用人单位依法安排劳动者在休息日工作，而又不能安排补休的，按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的200%支付劳动者工资;
(3)用人单位依法安排劳动者在法定休假节日工作的，按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%支付劳动者工资。 实行计件工资的劳动者，在完成计件定额任务后，由用人单位安排延长工作时间的，应根据上述规定的原则，分别按照不低于其本人法定工作时间计件单价的150%、200%、300%支付其工资。
经劳动行政部门批准实行综合计算工时工作制的，其综合计算工作时间超过法定标准工 作时间的部分，应视为延长工作时间，并应按本规定支付劳动者延长工作时间的工资。 实行不定时工时制度的劳动者，不执行上述规定。
三、单位不支付加班费怎么办?
单位不给加班工资，劳动者追讨加班工资要灵活选择途径。
1、协商。与用人单位进行协商解决，一般来说，如果单位不愿支付，协商无法取得效果的。
2、调解。有权调解的部门有单位的劳动争议仲裁委员会、人民调解组织、行业性、地域性调解组织。
3、投诉。向用人单位所在地的劳动监察部门进行举报，由劳动监察部门进行处理。劳动监察部门在调查有关事实的基础上，可以责令用人单位支付工资。劳动监察部门查处案件的时限一般不超过60日，特殊情况可以延长30日。
4、劳动仲裁、诉讼。向有管辖权的劳动争议仲裁委员会提出仲裁申请，劳动争议仲裁委员会应当自受理之日起60日内审理终结。对于仲裁裁决不服的，可以在收到裁决书之日起15日内向有管辖权的法院提起诉讼，诉讼按照民事诉讼程序，实行两审终审制。
实行综合计算工时工作制，其工作时间不区分制度工作日与公休日。故此类职员若是在公休日上班，一般情形下是不能获得加班费的。而若是实行标准工时制的员工，在公休日上班，则可以获得二倍工资作为加班费。
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