《工伤保险条例》规定，用人单位未提出工伤认定申请的，工伤职工或其直系亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起一年内，可以提出工伤认定申请。由此引出的问题是：劳动争议仲裁时效同样为一年，其起算点与工伤认定申请的起算点一致，但是劳动者要等到工伤认定决定出来后才能申请仲裁，而这时往往超过一年期。
对此有观点认为，申请工伤认定并不是劳动者的实体权利请求和救济，仅仅是一种程序性行为，因此无法引起劳动争议仲裁时效的中断。笔者认为，工伤认定是劳动者主张实体权利救济的必备前置程序，没有工伤认定，劳动者的权利得不到劳动争议仲裁委和法院的支持，所以申请工伤认定应视为向“有关部门请求权利救济”，从而引起仲裁时效的中断。
工伤认定部门对劳动关系可进行形式审查，但不能认为申请材料无法证明劳动关系的存在而不予受理。工伤认定部门可以对劳动关系的存否进行调查核实，并在行政行为的事实认定中予以体现。相对人不服的，可以以事实认定不清为由提起行政诉讼。
工伤认定程序中，劳动关系争议已经仲裁裁决的，工伤认定应以裁决为基础;工伤认定中当事人未申请仲裁的，应告知当事人有权申请仲裁，被受理后工伤认定中止，待裁决作出后恢复认定程序;如果在工伤认定中，当事人经告知后不申请仲裁的，可委托仲裁机构出具意见，之后当事人不得就劳动关系的存否再申请仲裁，也不得对该仲裁机构的意见提起民事诉讼。相对人不申请仲裁的，不影响工伤认定程序的进行，劳动关系仲裁并非工伤认定的前置程序。
如果先进行工伤认定，再申请劳动仲裁时，才能得到劳动争议仲裁委和法院的支持，在劳动争议被受理后工伤认定会中止，在劳动争议裁决后恢复工伤认定程序；如果先申请劳动仲裁，工伤认定是以仲裁结果为基础的。
