可以先由员工自己办理工伤认定的相关手续，然后由劳动争议仲裁委或者是人民法院裁定用人单位强制配合办理工伤待遇手续。
单位拒不配合工伤待遇的后果是依法对单位进行罚金处理，依据工伤保险条例可以得知，社会保险行政部门受理工伤认定申请后，根据审核需要可以对事故伤害进行调查核实，用人单位、职工、工会组织、医疗机构以及有关部门应当予以协助。
二、申请工伤所需材料有哪些?
1、工伤认定申请表;
2、身份证复印件;
3、医院诊断证明或职业病诊断证明;
4、工商企业登记档案资料
5、用个单位与劳动者存在劳动关系的证明(如：劳动合同、厂牌、工卡、证人证词、出入证、罚款单、警告信等)
6、工伤事故报告书
7、上下班途中发生交通事故，需提交交通事故认定书、路线图、房东证明及身份证复印件、邻居证明及复印件。
三、工伤待遇谁负责支付?
工伤保险待遇过去由用人单位支付逐渐转变为由工伤社会保险经办机构支付。
由于职工工伤保险待遇由工伤社会保险经办机构支付，用人单位不再支付工伤保险待 遇，发生工伤事故，对用人单位经济利益没有影响，用人单位防止工伤事故发生的积极性不高。
工伤事故发生后，由工伤社会保险机构支付工伤职工工伤保险待遇， 由用人单位支付工伤职工工伤精神损害赔偿，这种工伤事故责任的分摊方式，一方面可以更有效地维护工伤职工的利益，另一方面由于用人单位承担了部分工伤费 用，可以调动用人单位防止工伤事故发生的积极性，减少工伤事故的发生。
四、申请工伤认定期限是多久?
当职工发生事故受到伤害后，作为用人单位也好，受伤职工也好，除了积极治疗外，首先要把握好申请工伤认定的期限，这是受伤职工合法权益受到保障的前提。
对于申请工伤的期限，我国的《工伤保险条例》规定，“职工在发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区劳动保障行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报劳动保障行政部门同意，申请时限可以适当延长。”
职工在单位或者是其他工作场合因工负伤、在上下班途中遭遇非因本人主要责任的交通事故或者是职业病的，都可以认定为工伤，此时就可以要求用人单位配合办理工伤认定和工伤待遇的程序，如果用人单位拒不办理致使职工无法从工伤保险基金处获得工伤赔偿的，就应当由单位赔付。
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