应该盖公司的公章。因为，用人单位与劳动者签订劳动合同时，《劳动合同法》规定应在劳动合同上签章生效，即由法人代表签字，并加盖企业公章。单位通知劳动者解除劳动合同也应该与这个程序一致。如果盖内部部门章，不具备对外的效力。
附：《劳动合同法》相关条款：
第十六条 劳动合同由用人单位与劳动者协商一致，并经用人单位与劳动者在劳动合同文本上签字或者盖章生效。
二、种类
协商解除劳动合同没有规定实体、程序上的限定条件，只要双方达成一致，内容、形式、程序不违反法律禁止性、强制性规定即可。
若是用人单位提出解除劳动合同的，用人单位应向劳动者支付解除劳动合同的经济补偿金。
即具备法律规定的条件时，劳动者享有单方解除权，无须双方协商达成一致意见，也无须征得用人单位的同意。具体又可以分为预告解除和即时解除。
1、预告解除
两种情形：
(1)劳动者提前30日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。
(2)劳动者在试用期内提前3日通知用人单位，可以解除劳动合同。
2、即时解除：
即劳动合同法第38条规定的情形。对于第一款规定的几种情形劳动者可以单方解除合同。
注意：用人单位以暴力、威胁或者非法限制人身自由的手段强迫劳动者劳动的，或者用人单位违章指挥、强令冒险作业甚至危及劳动者人身安全的，劳动者可以立刻解除劳动合同，不需事先告知用人单位。这种属于即时解除中可以立即解除且不用事先告知用人单位的情形。
注意：对于劳动者可即时解除劳动合同的上述情形，劳动者无须支付违约金，用人单位应当支付经济补偿。
概要：即具备法律规定的条件时，用人单位享有单方解除权，无须双方协商达成一致意见。主要包括过错性辞退、非过错性辞退、经济性裁员三种情形。
为了更好的保障劳动者和用人单位的合法权益时，也是需要双方签订劳动合同的，那么在合同中也会写明双方的权利和义务，如果在合同履行期间，任何一方作出了任何的违法劳动合同或者劳动法的行为后，另一方也是可以凭借劳动合同来索要相应的赔偿，同时也可以解除劳动合同。
延伸阅读：
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