施工合同备案是由业主办理；施工合同即建筑安装工程承包合同，是发包人和承包人为完成商定的建筑安装工程，明确相互权利、义务关系的合同。
但现在已经取消施工合同备案、建筑节能设计审查备案等事项。将工程质量安全监督手续与施工许可证合并办理。
《国务院办公厅关于开展工程建设项目审批制度改革试点的通知》第(八)项
2、将工程质量安全监督手续与施工许可证合并办理。
建设工程施工合同是指发包方(建设单位)和承包方(施工人)为完成商定的施工工程，明确相互权利、义务的协议。
可以依据国家颁布的有关合同示范文本拟定建设工程承发包合同专用条款，并特别注意以下条款：
1、工程名称、地点、范围和内容;
2、工期，包括整体工程的开、竣工工期以及中间交付工程的开、竣工工期;
3、工程质量保修期及保修条件;
4、工程造价;
5、工程验收及工程价款的支付、结算方式、支付方式;
6、设计文件及概算预算、技术资料的提供日期及提供方式;
7、材料的供应及材料进场期限;
8、工程变更;
9、违约、索赔和争议;
10、当事人约定的其他事项。
若涉及到使用国际组织或者外国政府资金的项目，可能会被要求采用FIDIC条款，其他类型的建设工程项目也可以参照FIDIC条款起草并签署相关的合同文本。
三、施工许可证由谁办理？
施工许可证由建设单位办理，但是办理施工许可证之前有许多手续要办。施工承包中标通知书和承包合同备案，监理中标通知书和监理合同备案，然后是质监、安监，最后是施工许可证。建设单位办理，施工单位和监理单位配合的。
综合上面所说的，施工合同备案已不再是强制性的，而且国家已取消了此规定，只要在签订好合同之后办理好相关的证件即可施工，如果建设部门未办理施工许可证就开工，那么国家是可以认定此建筑是属于违法的，一般是受不到国家的保护。
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