首先，对于知道被侵害的判断应当从主客观两个方面结合进行分析，被侵害之日，一种客观存在的侵权事实的发生时间，但权利人是否知道这一时间点应结合患者及案件的实际情况分析。医疗侵权发生之后，其损害后果未必在短期内显现，而是具有一定的隐蔽性和潜伏性，有的长达几年甚至几十年，要求一个普通人在损害后果尚未显现的情况下就主张权利是不符合常理的。
其次，即使损害后果已经发生并为权利人所知晓，亦不能简单地将损害发生日作为诉讼时效的起算点，因为医学知识是十分专业的，不是非专业的普通人所能掌握的，医疗损害案件中损害后果是否为医疗活动所致，医疗行为与发生的损害后果是否具备因果关系并不能为普通患者所迅速感知，只有知道被谁侵害才能确定侵权人从而进行进一步权利的主张，权利人的权利被侵害后不知道因谁所致，则诉讼时效期间应自查清侵权人之日起计算。
二、特殊情况下的诉讼时效
在某些特殊情况下，比如患者对医疗损害发生的时间并不知道，而是做了医学检查之后，检查结果提示有损害的发生，损害结果发生的时间如何计算呢?如前所述，医疗活动是一项专业性极强的科学活动，其专业知识不被一般的普通患者所掌握，所以损害后果客观产生之日并不能作为诉讼时效的起算点。只有在通过医学检查后，发现了损害后果的产生并确定医疗行为与损害后果的产生有着直接的因果关系时，才能开始诉讼时效期间的起算。
