1、两者的本质不同。第三人撤销之诉本质是新诉，是对第三人实体权益的救济并且是第一次救济。案外人执行异议是特别救济程序。
2、两者适格主体范围不同。第三人撤销之诉的适格主体是“因不能归责于本人的事由未参加诉讼”的有独立请求权的第三人和无独立请求权的第三人，并且第三人必须是原审诉讼案件外的第三人。案外人执行异议的主体，法律没有明确规定，案外人申请再审之诉的主体主要是指物权人但不限于物权中的所有权人。
由该规定可知，能够提起第三人撤销之诉的适格当事人既包括有独立请求权的第三人，亦包括无独立请求权的第三人。同时，第三人撤销之诉这一制度的设立除了是赋予第三人在其因故未能参加诉讼而最终权利受损时的救济诉权，其目的还在于遏制近些年来屡见不鲜的虚假诉讼。在这些虚假诉讼中，原、被告常常通过骗取法院的生效法律文书来侵害第三人的合法权益。
执行过程中，案外人对执行标的提出书面异议的，人民法院应当自收到书面异议之日起十五日内审查，理由成立的，裁定中止对该标的的执行;理由不成立的，裁定驳回。案外人、当事人对裁定不服，认为原判决、裁定错误的，依照审判监督程序办理;与原判决、裁定无关的，可以自裁定送达之日起十五日内向人民法院提起诉讼。
按照启动程序的先后，当事人只能选择一种相应的救济程序，不能同时启动两种程序，且一旦选定不允许再审变更。具体操作如下：
1.先启动第三人撤销之诉程序的，即使第三人又在执行程序中提出执行异议，第三人撤销之诉继续进行。若第三人不服驳回执行异议裁定的，不能再按照《民事诉讼法》第的规定申请再审;
2.先启动执行异议程序的，第三人对驳回其执行异议裁定不服的，应按照《民事诉讼法》的规定申请再审，通过审判监督程序救济，不能再提起第三人撤销之诉。
执行异议之诉涉及的是执行程序的过程当中，是对执行的标的物提出异议，而第3人撤销之诉，指的是在民事诉讼的过程当中，对于法院所判决的生效的法律文书中的标的物产生异议，从而申请撤销，因此两者之间是有很大的区别的
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