农村耕地土地使用证可以到乡镇所属县区国土资源局办，具体情况可以咨询该乡镇土管所，可由工作人员协助组件报批。一般需要承包合同(协议)、身份证明、土地勘测定界材料等。资料齐全后并审批通过后，县区级国土资源部门会发给集体土地使用权证，一般有以下三种：
1、集体土地所有权证。县级人民政府对农民集体所有的土地进行登记造册，核发集体土地所有权证，确认所有权。
2、集体土地建设用地使用权证。县级人民政府对集体所有的依法用于非农业建设的土地进行登记造册，核发集体土地建设用地使用权证，确认建设用地使用权。
3、国有土地使用权证。县级以上人民政府对单位和个人依法使用的国有土地进行登记造册，核发国有土地使用权证，确认国有土地使用权。
二、收费标准和收费依据是什么?
1、土地登记费
①党政机关、人民团体、全额预算管理事业单位每宗地收10元;
②企业、自收自支单位土地使用面积在1000 m2(含1000 m2)以下每宗地收110元，每超过500 m2以内加收40元，最高不超过4万元;
③差额预算管理事业单位土地使用面积在2500 m2(含2500 m2)经下每宗地收160元，每超过500 m2以内加收20元，最高不超过1万元;
④城镇私房用于生产经营地土地使用面积在500 m2(含500 m2)以下每宗地收90元，每超过100 m2以内加收20元，最高不超过200元;
⑤城镇居民住房(私房)土地使用面积100 m2(含100 m2)以下每宗地收18元，每超过50 m2以内加收5元，最高不超过35元。
另外对于民房遗留问题，根据淮政发[2003]131号文件：超法定面积135 m2以上部分按90元/m2收取;
2、交易服务费：依照法律、法规不需要进入土地市场交易的,不交纳此费用。对土地使用权进行出让的，按照土地交易面积向受让方收取1.2元/m2;对土地使用权进行转让的,向交易双方收取2.4元/ m2,双方各承担一半;对土地使用权进行出租和抵押的,向交易双方收收取1元/m2,双方各承担一半。
以上就是农村耕地土地使用证的办理情况，应当严格按照土地管理部门的相关规定来进行处理，当事人在申请土地使用证时，应当提交合法真实有效的材料，如果相关材料不正确，或者对土地进行非法处理的则是无法办理土地使用证的。
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