农村自建房也有土地使用证，土地证是土地所有者或者土地使用者，享有土地所有权或者使用权的法律依据。根据《中华人民共和国土地管理法实施条例》，国家依法实行土地登记发证制度。依法登记的土地所有权和土地使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。可见，土地使用证在中国是确认土地使用权的法律凭证。中国的土地分为农民集体所有土地和国家所有土地，所以土地使用证也包括农民集体所有土地使用权证和国有土地使用权证。而其作用主要是为了保障产权安全：通过土地登记对购房人土地合法权益进行保障，经登记的住房用地，如果登记错了，购房人的土地合法权益受到损害，登记机关负赔偿责任;如果没登记，购房人就不能对抗恶意第三人，购房人的土地合法权益就得不到保障。保障交易安全：通过查询住房用地登记资料，可以判定所要购买的房屋土地是否合法，是否有合法的产权，以此保证房屋交易的安全。
1、申请
(1)由农村村民个人向所属乡镇国土资源管理所提出申请，领取土地登记申请审批表。
(2)提交个人身份证或农村居民户口簿复印件一份。
(3)土地权属材料(82年5月14日以前，提交村、队权属来源证明书;82年5月14日以后，提交农村建房使用证;97年4月以后提交农村建房申请书、农村建设用地批准书等)。
2、调查
由乡镇国土资源管理所对申请者的用地进行地籍调查、地籍测量、申请人现场指界、邻宗地签字盖章，填写地籍调查表，绘制宗地草图。
3、审核
先由乡镇国土资源管理所进行审核，再报县国土资源局审核，审核用地材料是否合法，用地界线是否无争议，用地面积是否准确。
4、审批
经审核符合“用地面积清楚，界址准确，权属合法，无争议”原则的，可批准并进行张榜公布，在公布一个月内无单位或个人对其提出争议的，由县人民政府颁发集体土地使用证。
尽管农村的土地是全体集体组织成员共有的，只不过，在实际使用的过程当中，一户一地的这种分配方式就让集体土地的使用相对规范一些。我们在农村修好了房子却不办理集体土地使用证，这样的话，如若和其他村民之间因土地使用权的问题引发了争执，自己就丧失了维权凭证。
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