办理宅基地土地使用证的程序如下：
1、向村委会写出书面申请。
2、填写申请表。
村委会同意后，由村负责填写《宅基用地呈批书》签署意见，村长签字，盖村委会公章。
3、乡镇政府审核。
乡镇政府根据上报资料到现场进行勘测，经审查合格后，由国土资源所长签字、主管乡(镇)长签署意见并盖乡(镇)政府章，然后上报县国土资源局。
4、县国土资源局接件后，进行资料审核并到现场进行勘测。
5、审核、勘测合格后，报县政府进行审批。
6、审批后张榜公示7日无异议的，国土资源所到现场定点放线，准予开工建设。
7、建设完工后，报国土资源所验收。
经验收合格后，由农房科组织相关材料发放《集体土地使用证》。
《土地管理法》第六十二条 农村村民一户只能拥有一处宅基地，其宅基地的面积不得超过省、自治区、直辖市规定的标准。
人均土地少、不能保障一户拥有一处宅基地的地区，县级人民政府在充分尊重农村村民意愿的基础上，可以采取措施，按照省、自治区、直辖市规定的标准保障农村村民实现户有所居。
农村村民建住宅，应当符合乡(镇)土地利用总体规划、村庄规划，不得占用永久基本农田，并尽量使用原有的宅基地和村内空闲地。编制乡(镇)土地利用总体规划、村庄规划应当统筹并合理安排宅基地用地，改善农村村民居住环境和条件。
农村村民住宅用地，由乡(镇)人民政府审核批准;其中，涉及占用农用地的，依照本法第四十四条的规定办理审批手续。
国家允许进城落户的农村村民依法自愿有偿退出宅基地，鼓励农村集体经济组织及其成员盘活利用闲置宅基地和闲置住宅。
国务院农业农村主管部门负责全国农村宅基地改革和管理有关工作。
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