水库移民补偿标准主要规定在《大中型水利水电工程建设征地补偿和移民安置条例》。
第二十二条 大中型水利水电工程建设征收土地的土地补偿费和安置补助费，实行与铁路等基础设施项目用地同等补偿标准，按照被征收土地所在省、自治区、直辖市规定的标准执行。
被征收土地上的零星树木、青苗等补偿标准，按照被征收土地所在省、自治区、直辖市规定的标准执行。
被征收土地上的附着建筑物按照其原规模、原标准或者恢复原功能的原则补偿;对补偿费用不足以修建基本用房的贫困移民，应当给予适当补助。
使用其他单位或者个人依法使用的国有耕地，参照征收耕地的补偿标准给予补偿;使用未确定给单位或者个人使用的国有未利用地，不予补偿。
移民远迁后，在水库周边淹没线以上属于移民个人所有的零星树木、房屋等应当分别依照本条第二款、第三款规定的标准给予补偿。
二、水库移民是什么意思
水库移民也即水工程移民，是居住地由于水利工程的需要，必须根据政府安排搬迁到他处的群众，也叫库区移民。国家对此有一系列的法律、行政法规、法规性文件、部门规章和规范性文件、后期配套政策等措施来保障水工程移民的顺利开展和可持续发展。
为了帮助移民改善生产生活条件，国家先后设立了库区维护基金、库区建设基金和库区后期扶持基金，努力解决水库移民遗留问题，对保护移民权益、维护库区社会稳定发挥了重要作用。
1、《国务院关于完善大中型水库移民后期扶持政策的意见;
3、《关于印发〈大中型水利水电工程移民安置验收管理暂行办法〉的通知》。
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