外资企业主要以加工贸易的方式经营。海关以往的加工贸易监管规定往往只是针对特定时期的某一种贸易方式或某一项业务而制定，缺乏一部系统的、全面的监管规章。另外，多数加工贸易的监管规定制定的立法环境、条件已发生很大变化，有些规定出现不适应状况。针对上述原因，《中华人民共和国对加工贸易货 物监管办法》也就应运而生，对以往规定进行了整合与规范，并于2004年4月1日开始正式实施。
我国加工贸易管理实行保税监管制度。从1995年开始，海关根据国务院规定，对加工贸易实行银行保证金台帐管理制度，有效地保障了国家关税的税收， 但仍需进一步完善。《海关法》对海关要求企业提交担保的范围、方式已有原则性规定，因此，新的《加工贸易货物监管办法》规定海关对加工贸易实行担保制度， 规定了担保适用的有关情形，规定了担保的解除条件。
核查是加工贸易海关监管的手段，因此《加工贸易货物监管办法》明确了海关“核查”的法律地位，保留了海关对企业进行勘验、核查的权力，规定海关根据监管需 要，可以对企业进行核查，企业应当予以配合。另一方面，加工贸易海关监管还应与企业管理密切联系，关注的重点从货物转到企业与货物并重，重点放在企业自 管。要求加工贸易企业须经海关注册登记，按规定设置并向海关报送有关帐簿、报表和其他单证。
另外，进一步完善加工贸易和保税监管法规体系，建立健全“企业自管、海关监管、地方政府协管、社会共管”的综合治理机制等工作，中国海关海关实行联网监 管。来自海关总署的资料显示，到2005年底，海关共对2，290家大型加工贸易企业实施了联网监管，联网企业加工贸易进出口值已占中国全部加工贸易进出口值的56.5%.
