1、鉴定机构不同：医疗纠纷一般是委托进行医疗过错鉴定，而医疗事故是采用医疗事故鉴定;
2、赔偿标准不同：医疗纠纷的赔偿标准是《最高院关于审理人身损害赔偿案件的司法解释》，而医疗事故的赔偿标准是医疗事故处理条例;
3、是否有行政责任不同：医疗纠纷一般没有行政责任，而医疗事故会产生行政责任，就是有卫生行政部分进行处罚医疗机构和医务人员。
医疗纠纷通常是由医疗过错和过失引起的。医疗过失是医务人员在诊断护理过程中所存在的失误。医疗过错是指医务人员在诊疗护理等医疗活动中的过错。这些过错往往导致病人的不满意或造成对病人的伤害，从而引起医疗纠纷。
除了由于医疗过错和过失引起的医疗纠纷外，有时，医方在医疗活动中并没有任何疏忽和失误，仅仅是由于患者单方面的不满意，也会引起纠纷。这类纠纷可以是因患者缺乏基本的医学知识，对正确的医疗处理、疾病的自然转归和难以避免的并发症以及医疗中的意外事故不理解而引起的，也可以是由于患者的毫无道理的责难而引起的。亦有人称之为医疗侵权纠纷，即医疗服务的提供者与接受者之间对医疗行为及其后果是否侵权及侵权责任的争议
医疗民事纠纷与其他民事纠纷一样，属于平等主体之间的财产关系和人身关系，属民《民法典》的调整范畴。根据“私法自治”的原则，通常情况下，国家不予干预，因此，双方当事人可以就医疗纠纷进行协商，也可以进行民间调解和行政调解，从理论上讲，医疗合同纠纷也可进行仲裁解决，但仲裁解决医疗纠纷还不受重视。国家对医疗民事纠纷的干预表现为民事诉讼，需要当事人起诉才能发生。也可以申请卫生行政部门解决。
无论是医疗事故还是医疗纠纷，首先都必须由医院向上级卫生行政部门进行申请，调查组来按照相应的事故标准来进行成立调查组，调查组会根据实际情况来进行调查。一般来说，调查组都会按照事实情况以公平公正方式来进行调查。
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