山海关一战，已为清军打开了通往北京的道路。战斗结束后，多尔衮代表清世祖封吴三桂为平西王，吴三桂受宠若惊，更下定决心为清朝效劳。多衮乘胜挥兵，继续让吴三桂打头阵，直取北京。
李自成被迫后撤，于四月二十六日回到北京。这时北京城内谣言四起，人心惶惶。李自成决定撤出北京，转移山西、陕西。二十九日，李自成在武英殿即皇帝位，举行了隆重的仪式。三十日晨，他率农民军离开北京。
五月一日，清军进抵北京。多尔衮命令吴三桂军队和其他各部清军不必进城，继续追赶农民军，他自己则率众官员进入北京城。明朝原来的官员和遗老遗少出城迎接，表示对新主子的归顺。
这年十月，清政权由沈阳正式迁到北京定都，清世祖在北京爬上了统治全国的皇帝宝座。从此，中国历史进入了清王朝的统治时期。
