乾隆52年（公元1787）冬，55岁的香妃却忽然去世了。关于她的死亡，众说纷纭，主要流传两种说法：一是病死，二是被皇太后赐死。
关于病死说，是说一次偶染风寒后，卧病不起，最后竟然不治而亡。
而关于它杀一说，主要证明可以参照1914年古物陈列所展出的所谓香妃戎装像下写的文字说明：“香妃者，回部王妃也，美姿色，生而体有异香，不假熏沐，国人号之曰香妃。或有称其美于中土者，清高宗闻之。两师之役，嘱将军兆惠一穷其异。回疆既平，兆惠果生得香妃，致之京师。帝命于西内建宝月楼（即今之新华门）居之……如是者数年。皇太后微有所闻，屡戒帝弗往，不听。会帝宿斋宫，急召妃入，赐缢死……”
虽然这段记载的时间令后人存疑，但这种说法在民间却流传已久。总之，而关于她的死亡，数百年来也是个谜团。
而香妃死后，乾隆皇帝悲痛欲绝，按照容妃遗嘱，降旨把香妃的遗产遗物分别赠送给十公主、大格格、太监、宫女、厨子以及香妃在京城的娘家人，以为留念。同时，相传乾隆皇帝还派了一大批送葬队伍，抬着香妃的棺木返回故乡，棺木不准落地。当棺木送到喀什时，送葬队伍只剩下六人。最后，香妃被葬在了阿帕克霍加墓群中，人们将这座陵墓称做“香妃墓”。
然而，这只是传说，而香妃的真正埋藏之地，却在近两百年后揭开真相。
1979年国庆节，河北遵化因为连续降暴雨，乾隆皇帝的裕陵里的一座妃子墓前的石踏出现下陷。河北省文物局闻讯派来抢修，抢修过程，他们根据档案记载，发现一个惊天秘密，这座墓的主人竟然是乾隆皇帝的宠妃香妃墓。
考古人员用抽水机抽干地下水后，打开了墓室的门进入地宫，在棺木上，他们发现了一段用金漆书写的文字。考古人员把文字临摹下来，又带着香妃的头骨和发辫去北京找专家鉴定。专家鉴定的结果是：这就是乾隆的香妃墓。理由是：墓中文字都是阿拉伯文，内容是《古兰经》起始句，墓中主人为女性，身高1米63，享年55岁，一切都和乾隆的容妃相吻合。
