长 期服用短效避孕药者，由于停药后就会有月经来潮，可以使月经周期变得规律。但是，因为药物能抑制排卵，卵巢分泌的雌激素逐渐减少，子宫内膜缺乏雌激素的影响，不能正常生长而变薄，所以会有月经量逐渐减少，经期缩短，甚至发展为闭经。故一般都主张连续服避孕药的时间不能过长，如果已持续服用半年，最好先停用2－3个月，以使维持月经周期的自然调节机制有机会恢复，然后再重新开始用药才好。
有的人在服药期间出现不规律的出血，这种出血通常表现点滴状或淋漓不净，无一定规律，被称为“突破性出血”。按时服药除了月经之外本不应该发生出血，因此首先考虑是否漏服药了。可是绝大多数人都没有漏服药，却是边服药边出血，以致令患者非常苦恼。
那么服同样剂量的避孕药，为什么有的人闭经，而又有人引起淋漓不净的出血呢？专家们一致认为，服用的口服避孕药中虽然含有雌激素和孕激素，为了减少副反应都已经减少到最低剂量，有时虽然能抑制排卵却不足以维持子宫内膜的生长。每个人对药物的反应有极大不同，而这些个体差异又是事先并无法察知的。所以，在服药期间如有出血还得依靠调整外源的性激素剂量来纠正。“突破性出血”如发生于前半周期，可能是由于雌激素量不足所致，每日应加服1片快雌醇糖衣片，直到服完 22天至应该停药时；假如发生于月经周期的后半期，可能是由于孕激素不足所致，需要每晚再加服1片避孕药或单纯含孕激素的制剂，也是维持到22天再停药。出血如果已经超过月经量或者发生于接近应该停药的日子，就不如索性停止服药，把这次出血当作一次月经，可以于停药的第5天再重新开始下一个周期。
