我国的财务核算工作起步比较晚，传统的财务核算是指核算凭证工作、会计账簿和会计报表等其他会计核算专用资料，是记录和反映各企业经济业务的重要史料和证据。
第一，财务核算工作模式不尽科学。现行一般单位(公司、学校)都设置财务核算中心机构，实行自体一级核算模式，来处理各单位(公司、学校)账务管理，教学、科研、后勤产业等方面的财务核算工作，同时要求核算工作人员能独立和全面地完善审核业务。在具体工作中，做凭证工作，工作量还是比较大的，每一张原始凭证都要做成记账凭证，财政支付的要求也越来越规范化、明细化，学校对外交流、培训、合作办学的项目在不断增加，这样要求做账的科目和内容就会增加很多，对应的科目都必须在对应项目中支，使得工作量增加了不少。但是每个月财务核算部门能按时、准确地将票据做成记账凭证，生成报表，能满足校内各部门对经费核算、财务信息需要的要求;保证会计信息的可比性和统一性;充分考虑在接受各级各类部门检查中、数据统计过程中的可操作性和高效性，并认真核对，使现金、银行和财政支付的余额一致，做到做账准确，账实相符。
第二，核算服务与核算监督职能定位模糊。随着市场经济规模的快速发展，多渠道来源科研经费与资金使核算经费也呈现出多元化模式。原有财务数据存在口径不一致等问题，在财务清算的基础上和核算过程中，必将产生各种各样的难以预计的矛盾，如核算人员拒绝支付与费用支持请求会经常发生冲突，结合数据形成的历史原因认真分析，按新制度将数据尽可能合理地并入新设置的适当的财务核算中。合理、妥善的处理和化解核算服务是工作关键点。在广大的核算人员心中是监督严一点，还是核算服务好一点都很难准确的定位。
针对上诉问题，财务核算工作如何适应体制改革要求，为更好地执行新财务核算工作，使其发挥更好、更大的作用，更好地发挥财务核算职能，根据财务核算业务的整个流程，分别做好财务核算的数据、保存和利用等方面来陈述工作。
第一，更新财务管理软件，加快信息化建设步伐。所谓财务会计信息化建设是在一定的时期和特定的时间范围内(如一个季度)，进行财务软件系统改进措施，引入嵌入式管理控制模板，在系统中有时侯没有及时的将财务软件版本和软件系统很好地保存，造成会计档案不能被调阅。我们所调阅的财务核算会有两种情况：一是所调阅的财务核算的版本号与当前财务核算系统版本号一致，此时只需通过财务软件系统中的调阅(或数据恢复)功能将您所需调阅的版本号进行输入即可进行调阅;二是所调阅的财务核算的版本号与当前核算软件系统版本号不一致，此时您只需在另外一台电脑上将此文件对应的版本系统进行安装，然后就可以进行调阅。建立校内科研经费管理与财务系统的有效对接，实现数据共享。任何一个单位(公司、学校)每天都会发生经济活动和财务支出，运用财务管理是一项细致严密的工作，同时也能反映发生或已完成的各个项目经济活动，同时运用了现代的科学理论、方法和各项管理技术，积极的开发管理会计。
第二，完善财务核算保存和财政体制。财务核算管理不仅是客观上的记录和储存内容，而是存储在磁性介质或光盘上，根据信息转载的特殊物理性，更应该注意管理财务核算与对应的财务样板保持一致性。在财务核算业务处理过程中，各项财务管理措施必须注意到经费核算的复杂情况，不能盲目地“一刀切”，应正确处理经费开支标准和实际支出之间的矛盾、预算编报额度。每个月财务核算部门能按时、准确地将票据做成记账凭证，生成报表，并认真核对，使现金、银行和财政支付的余额一致，应兼顾不同经费的特性，分类处理，做到做账准确，账实相符。促使管理财务核算的程度得到更深层更高层发展，管理财务核算除了保存各版本的备用财务数据外，还要保存好原版本的资料，二者都非常重要，从而可以看出收集和管理工作也是一个比较艰巨的任务。
在新财务核算工作的实效性下，建立与国家预算体制相符的核算服务体系，建立有效的财务人员激励机制，转变高校核算模式，优化报账流程，在现有的财务核算软件中融入了会计、财务、管理等先进的技术和方法，进行新财务制度的学习和培训，结合应用的软件培训是实现会计信息化的正常运行的前提。
