香菇子实体在生长过程中常常因生产条件的调控不到位而产生畸形菇，影响菇品的商品质量及其价值，使生产效益大打折扣。
畸形菇症状
①出菇密，丛生，菇盖不圆整，菇柄着生位置不规则。
②菌丝集结成团，分划不出柄和菇盖。
③菇柄过粗或菇盖畸形，盖小或无盖。
畸形菇发生的原因
①品种选择不当。如海拔高的山区，应选中、低温菌种为宜。若误用高温型菌种，冬季菇蕾一出现，遇低温便萎缩不长，形成"松果菇"。香菇菌株已生理成熟，在不适宜的季节环境下勉强出菇，常长出与种性不相符的子实体；有的菌株如原为椴木栽培菌株，适应在含氮量很低的椴木中出菇，在木屑、麦皮等含氮量高的培养基中造成生理障碍常出畸形菇。
②发菌管理不当。在菌丝体培育期间，如果发菌室光照过强，靠近窗口的菌袋原基提早形成，袋内菇蕾早现，受袋壁挤压，无法正常伸展。因此，脱袋后第1批菇容易出现畸形。
③脱袋转色不合标准。有的菇农单凭菌龄，而未掌握菌丝成熟的条件。因此，脱袋转色差，菇态畸形。
④菌筒浸水不适宜。早熟品种一般出菇2-3批后，菌筒水分下降，需浸水补液。但有的菇农采用的是晚熟品种，也跟着浸水（此时正是晚熟品种处于形成原基时期），一遇水分刺激，迫使原基提早分化，只长菌柄，便形成了"蜡烛菇"。
⑤控湿保温不合理。冬季气温低，菇床上薄膜罩不严，受寒风袭击，正在生长的菇蕾就萎缩干枯成畸形；相对湿度低于70%时，则会出现菇柄柔软或空心。
⑥除部分遗传原因外，假菇主要由原基形成部位过深，大量养分消耗于菇柄生长或者脱袋时气温过高所致。
⑦割袋不及时。用不脱袋出菇栽培方法，容易因菇蕾产生后，割袋不及时，使菌袋压迫菇蕾，造成菇蕾畸形。
⑧环境不适。在香菇原基分化的过程中，出菇场二氧化碳浓度过高；光线太弱；空气相对湿度过高；菇蕾产生后遇到菌袋压迫；机械碰伤等因素都容易出现畸形菇。
⑨生理不成熟，配方不合理，氮素含量过高，通风不良，品种不好，棚内长期处于低温。
畸形菇防止措施
①了解菌性，防止引种失误。栽种前，首先需弄清菌种特性，选用经严格出菇试验、保持优良种性的菌种，以此安排接种季节，推算预定的接种时间。不要使用不明种性的菌株，而应选用已驯化成熟或选育成功的香菇菌株。根据菌株的温型特性和栽培地的气候条件，合理准确地安排好生产季节。
②了解菌丝成熟特征，防止盲目脱袋。脱袋过早，菌丝未达到生理成熟，变异菇就多。菌丝生理成熟应掌握"一个菌龄、三条标准"。"一个菌龄"即从接种之日起，经过60天左右；"三条标准"是，袋内瘤状突起的泡沫菌丝占整个袋面的2/3，局部出现棕褐色；手握菌袋有松软弹性感，此时脱袋才适宜。常规菇脱袋时间宜在气温连续3 d（天）低于16℃时进行。
③掌握转色规律，防止温度失控。转色期间要注意气温变化，头3天在25℃以内，菇床上的盖膜不必揭开通风。在正常情况下，12天转色结束，3天后出现第一潮菇。转色时，要求温度不能低于12℃，不能高于25℃，出菇期的最佳温度为15℃。
④掌握变温原理，防止温差刺激不够。变温适当，出菇多，形态好，无畸形菇。正确的变温法是白天用薄膜罩住菇床，晚上12时后揭开薄膜1小时，使日夜温差在10℃以上，菇蕾大量发生。要求在转色后连续变温3-4天。
⑤及时适量浸水，防止水分过高过低。菌筒含水量低于40%时，出菇难，小形菇多。一般以菌筒的重量比原来下降30%时，可进行浸水，以吸水后达到制袋时重量的95%就足够了。若吸水过饱，易造成菌丝呼吸困难，影响正常长菇。
⑥菌丝生理成熟后再催菇。催菇方法要适当，防止偏干偏湿。每采完一批菇后，必须揭膜通风6-7天，使菌丝吸足氧气，以恢复生长能力，然后转入喷水保湿，干湿交替，催促下一潮菇蕾发生。不要在菌丝尚未成熟的时候，采用如“惊蕈”等办法强迫菌筒出菇，搬运发好菌、生理成熟即将出菇的菌棒时应减少震动。
⑦适时采收。防止过熟。可在菇盖有卷边、菇柄适中时采收。一般每天采菇1次，但春季产菇高峰期，有时每天要采菇2次。
⑧第1潮菇的催菇应视品种和菌棒含水量而定，容易出菇的品种提倡自然出菇，不需催蕾。不易出菇的品种或含水量不足的菌棒，通过浸水软化菌皮，以利出菇，而不应采用注水的办法。不易出菇但含水充分的菌棒，可结合最后一次刺孔增氧达到催蕾的效果。
⑨培养基配方严格按照合理比例，切勿含氮量过高，碳氮比要合理。增大碳素比例。出菇阶段一般是60：1。
⑩出菇场所的环境条件尽量满足香菇子实体生长发育的需要，尤其是光线、通气、空气相对湿度等条件。加强通风，增加光照，保证适宜的温度。
常见畸形菇的主要表现及防治措施
①菌盖小而薄：表现为菌盖既薄又小，即使菇龄较长也无法长大，鲜食时没有香菇的特殊香味；其发生原因一是没有完成转色，花菌袋或白菌袋即进行出菇；二是基料营养明显不足；三是生长的温度偏高。防治办法：没有转色的菌袋，一定要调控条件进行转色；如果基料营养不足，则可在浸泡菌袋时予以适当补充，也可采取“叶面施肥”的办法，比如喷洒食用菌三维营养精素，即可有效加厚菌盖厚度；夏季气温较高，应采取有效的降温措施，如果采用“水冷空调”，效果较好。
②菌盖灯罩形：菌盖呈尖头的灯罩形状，并且明显薄，商品质量严重下降。主要原因与上述相同，因此，可参照上述进行防治。
③菌盖波浪形：菌盖边缘呈较规则的波浪形状，亦明显较薄、较脆。发生波浪形主要与幼菇发育阶段接受了较大温差的时候，同时环境的湿度变化亦很大，尤其当大水直接喷淋于菌盖时，很快就有较大风流吹过，而使得菌盖组织发育不正常。防治办法是发生菇蕾后，应保持较平和的温度和湿度，尤其夏季反季节栽培时，菇棚的温度往往是决定子实体能否正常发育的基本条件。
④菌盖不周正：具体表现为菌盖别三扭四，或狭长、或三角等等，总之，不圆整是其主要特征。发生原因主要是幼蕾阶段没有及时切开塑膜，使其菌盖直接顶到塑膜上接受了一定的摩擦，或者菇蕾发生比较多，没有及时疏蕾处理，待长至幼蕾阶段，菌盖分化后挤在一起，只要幼时菌盖受挤压，则永远不会再重新圆整。防治：及时割膜，并进行疏蕾处理，一般只选1～2个幼蕾，勿使过多。
⑤菌柄空心：菌柄细长、空心，导致菌盖也很小，主要是基料含水率过低以及空间湿度太小等原因所致。防治措施：每采收一潮后，即应进行泡袋处理，一般浸泡24小时即可使之恢复原重，保持菇棚空气湿度在85%以上。
⑥菌柄从裂缝中长出：菌袋含水率过低时，基料开裂，形成狭长的裂口后，即可有子实体从裂口内长出，有的甚至没有完全钻出来，菌盖就在裂口内长大，最终也无法实现其商品价值。防止办法是坚持菌袋浸泡处理，不使其形成裂口。
⑦菌柄扭曲：菇棚空气湿度偏低、光照较强或光线角度变换过频时，易发生该现象。防止办法是保持相对稳定的空气湿度，并保持较稳定的光照，一般要求有1000勒克司的散射光即可满足。
⑧蜡烛菇：蜡烛菇的特征就是光秃秃的菌柄上，没有正常的菌盖组织，形似蜡烛。发生原因，一是菇蕾阶段菌盖组织受损，二是棚内二氧化碳浓度过高。防止措施：及时割膜；疏蕾时注意不要伤及欲留蕾；坚持较好的通风，保持棚内较清新的空气条件。
⑨香菇团块菇：自原基阶段即为小团块状，单生，不能分化，近无柄，至成熟时整个团块较松软，没有正常的香菇香味，无商品价值。防治措施：彻底解决种源问题。尤其分离菌种和外引菌种时，一定要做出菇及品比试验，否则，不得用于生产。有技术条件的应对菌种进行脱毒处理，或引进脱毒菌种后进行扩繁。
⑩香菇连体菇：如同连体动植物一样，或是两个菌盖相连，或是两个菌柄相连，属典型的畸形菇，严重影响产菇数量及其商品价值。防治措施：对菌种进行脱毒处理，彻底解决种源问题，以保证生产效果。严格配料，不过多使用某些辅料，尤其某些不明成份的辅料，应禁止应用于生产。管理工具如喷雾器等，最好能采取专用设备，尤其喷雾器如用作大田喷药后再用于菇棚时，必须严格清洗，并使用碱性溶液如肥皂液、洗衣粉之类冲刷2遍，再用清水充分清洗后才能用于生产。
(11)大脚菇：对于高温型品种如果制筒较迟，出菇时遇低温影响而形成。防治方法是根据选用的品种对温度的要求，合理安排栽培季节。
(12)空心软柄菇：菌筒失水严重，空气湿度偏低，气温偏高，幼菇脱水而形成。防治方法是每采完一潮菇后应及时浸水处理。
(13)螺盖菇荔枝菇：高温型品种生理尚未成熟而又在低温条件下进行催蕾出菇、低温型品种在生理尚未成熟时又在高温环境下催蕾出菇、培养基中氮源添加过多等都易产生畸形菇。预防方法是严格掌握品种的温型特点，安排好接种和出菇期，摘掉螺盖菇，养护好菌丝体，待气温、菌龄等条件适宜时立即进行催蕾出菇。
(14)葡萄菇：对于小叶品种，若麸皮添加过多或因拌料不均匀使麸皮等偏于袋的某一局部而形成。防治方法：配料合理，拌料均匀。
(15)拳状菇：装袋料松紧不一，料内供氧不均匀，打穴接种太深等而形成。防治方法是改装、修理装袋机，使之吐料均匀，装袋手握袋时要用力均匀，促使装料松紧一致，打接种穴不要过深，一般为1~1.5厘米。
(16)长柄菇、偏角菇：当菇棚内过分潮湿，出菇时遇高温气候，菌筒排放过密，光线太弱，二氧化碳浓度过高等而形成。克服办法是菇棚内挖沟排水，菌筒适当摆稀，加强通风。
