哈密瓜有后熟作用，用于贮藏的瓜果首先要选择耐藏品种。晚熟品种较耐贮藏，它的果皮坚韧，具有弹性，肉质致密，瓜面光滑，有蜡质层。早熟品种不宜长期贮藏。
用作贮藏的哈密瓜，平时就应控制灌水量，早停水，可提高瓜的耐藏性。其次要掌握适宜的采收期，可以适当提早采摘。一般在正常采收期前6-8天，八九成熟时采收。采时要轻拿轻放，不要擦伤瓜皮。凡瓜皮擦伤、碰伤的一概不能贮藏。包装与运输时要注意尽量减少途中激烈震荡，平稳装运。瓜采下后，就地晒瓜1-2天。
贮藏之前进行灭菌消毒，或用虫胶涂果顶和果柄，可取得很好的效果。灭菌消毒方法有：①温水浸渍。用55-60℃（不能超过62℃）的水浸果1分钟。②药剂灭菌。用2000ppm次氯酸钙或1000ppm特克多、苯来特、多菌灵、托布津，或500ppm抑霉唑等浸果0.5-1分钟，也可以把一些药剂结合使用。
