高山族相信祖灵具有不同寻常的法力，对其崇仰备至，各族群、各部落都形成一套祭祀制度，借以对子孙后人赐福禳灾，并维护以血缘为纽带的共同群体的团结与力量。除了专门的祖灵祭以外，出猎、打仗、驱虫、除草、求雨等活动，都要先祭告祖先亡灵，祈求福佑或降兆。
祖灵祭常在丰年祭后举行，或与丰年祭合并举行，目的在祈求丰收、子孙繁盛与健康平安，也有报谢及以新谷供献祖先之意。祖灵祭或以亲族为单位举行，或以部落为单位执行。
泰雅人大崁群各家于祭日的清晨捣小米捏成饭团，各家长持饭团到祭司家，用松叶和麻丝包扎，把饭团缚于树枝或新竹上。接着由主祭率领，各家长持饭团随后，走到山中大树下，大家再把饭团绑在大树枝上，由祭司高呼诸族名字，唱祝词。祭毕一起归社，开始宴饮。
赛夏人的祖灵祭以地区祭团为单位，各家长集合在祭司家中，祭司家梁上悬有一个“神物袋”为祖灵的神位。祭日当天大家各持一把糯粟到祭司家合捣成糕，祭司则蒸米为饭以祭祖灵，唱祝词祈求佑护。祭毕，各家分糕共享，是日各家开始宴饮。
排湾人的“五年祭”又称“迎神祭”，每五年举行一次，通常在小米收成后举行。传说，排湾人的祖灵，每五年来探访子孙一次，为了感谢祖先保佑他们的幸福生活，每隔五年要举行一次祭祀活动。祭前，祭司卜日遣人上山采竹和藤蔓袁制作藤球和刺球的竹竿，酿酒、制糕、杀猪，整治场地。家族主妇设祭，请暴卒横死的孤魂野鬼到插着绿竹的石凳纳凉小憩，勿再惊扰祖灵莅临。房前屋后、墓地等处设祭祀奉祖灵，并与祖灵观赏规模空前的刺藤球仪式。五年祭中的刺球赛和舞会最为热闹。刺球赛由为首者将藤球掷于空中，青年们各执一竹枪向之刺去，以刺中次数最多者为优胜。舞会则是全村青年参加，由本村最大头目邀请全村青年饮宴跳舞，这两项活动也是成年仪礼的节目。仪礼中青年们在自己家门口和身上佩戴茅草结，以示驱除恶灵。仪式始终充满娱神悦祖、祈神禳福的吉庆气氛。然后，祭司率领部落成员上山围猎。最后，各家还要送神牌、长矛等到部落首领家里。祭司作祭以后，选取其中精美的祭品，将它们丢弃到村外，以示送神。
平埔人当中的西拉雅人认为祖灵贮在被称为“安平壶”的陶罐中，一般将陶罐供奉于部落会所或家宅的祭坛上，数量及装饰因部落而异，一般有三个，颈部饰以红布，口部插芭蕉叶。罐里装清水，月初或月半换水一次。平时祀奉米糕、槟榔与兽骨等。
