原果汁饮料的品种很多，不论何种果汁饮料，除了原料及处理不同之外，其加工工艺方面并无根本区别。这里仅介绍柑桔汁饮料的加工工艺。
先介绍其工艺流程：
进厂的原料经人工挑选，剔除霉烂果、严重伤害果等不符合加工要求的果实。再进行清洗，洗净后的果实用0.1%～0.3%高锰酸钾溶液浸泡消毒。
柑桔的外果皮上有许多的油胞，通过磨油机将油胞磨破，再用水冲淋，使流出的柑桔油流入贮液桶，进一步加工提取精油。
接下来要进行榨汁，目前大规模生产都用完全自动化的榨汁生产设备。将榨出的果汁根据成品的要求进行过滤，过滤一般先粗滤，后细滤，以排除果渣及种子。
通过过滤后的果汁按成品果汁标准加以调整。调整是添加适量的糖或酸，添加之前要进行溶解、过滤、冷却。
经调整后的果汁需进行脱气处理，也就是除去果汁中的空气，因果汁中有空气存在，果汁的色泽和风味要变坏。脱气一般采用真空脱气机。
采用金属罐头包装的柑桔汁，加工时不需均质。用玻璃瓶包装则需均质，均质后的柑桔汁再经灌装、杀菌、冷却后即为成品。
