由于CMV不显性感染广泛存在，因此在解释实验室阳性结果时要慎重，必须结合病毒分离、血清学和细胞病理学检查方能得以肯定诊断，那么小儿巨细胞病毒肺炎都应该检查哪些呢？
采取患儿的尿、咽洗液、痰、胃液、脑脊液或脏器活检及尸检组织接种于敏感细胞中，培养24h后，经特殊染色可见包涵体。出现细胞病变需几天至2周，甚至长达6周。用补体结合试验或中和试验的方法检测患儿急性期与恢复期双份血清，二者抗体效价超过4倍以上升高，即为阳性结果，补体结合试验效价高于1∶8时，可考虑曾受CMV的感染(活动性感染)，这些传统的方法结果准确可靠，需要较长的时间，作出回顾性诊断。近年来已建立一些更为敏感的方法，其中最主要的有免疫荧光法、酶联免疫法和放射免疫测定法等，今介绍几种有助于临床的快速早期诊断方法。
1.早期抗原(EA)测定法 在CMV感染后数小时，病毒DNA复制之前即已出现一种早期抗原，其性质尚不明确，但可作为CMV感染早期的一个指标加以检测，使用免疫荧光或酶联免疫法能检出EA在血清中的水平。有人认为EA的出现不仅表示早期CMV感染，而且还可能显示既往潜伏感染激活。
2.特异性IgM测定法 CMV感染后血清抗体首先上升的是特异性IgM，运用敏感的放射免疫或酶联免疫法可在早期测出这种特异性的抗体反应，从而作出早期快速诊断。由于IgM不能通过胎盘，故在新生儿中测得CMV特异性IgM，即可说明是活动性感染。
3.对流免疫电泳粗筛试验 将已知抗原(CMV)置入阴极板，待测患儿血清置阳极板，运用对流免疫电泳仪可测出血清中特异性IgM，此种方法几小时即出结果。方法简便，但灵敏度不甚高，仅能测出补体结合抗体调度1∶128以上的阳性血清，可用作粗筛试验。
4.尿沉渣细胞检测 取一滴尿沉渣，固定后染色，然后置普通光学显微镜下观察，可见到特殊形态的巨细胞，其胞体增大，胞核膨胀，周围有一“晕”环绕，类似鹰眼，胞浆及胞核中均可见嗜伊红染的包涵体，此种细胞为CMV感染所特有。此法应多次耐心进行检查，以提高阳性率。未查到巨细胞者不能排除CMV感染。 5.其他 周围血象单核细胞增多，有时可有血小板减少。血生化检查有黄疸或代谢性酸中毒和低氧血症等。
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