转基因食品现在已经广泛的存在于我们的日常生活中，我们每天消费的食品可能有很大一部分都是含有转基因成份的，现在虽然没有专家证明转基因食品对人体一定有危害，但有些是潜在性的，我们不可大意。
1.可能危害有益昆虫类群
大量转基因农作物转入了Bt毒蛋白基因作为其抗虫的外源基因，虽然其表达产物Bt毒蛋白对人类无害，但若是以农作物为食的害虫消失殆尽，以这些害虫为食的益虫边也遭受灭顶之灾了。长期大面积种植这种作物可能会对有益昆虫类群造成难以挽回的危害，一旦这种现象发生，不仅会对农业造成危害，也将是对生态环境的沉重打击。
2.可能导致土壤肥力下降和化肥的滥用
大量种植以抗杂草基因作为外源基因的转基因作物，会使土壤中自然的腐殖质逐渐消耗殆尽，使土壤本身的肥力下降，为了保证产量，农民不得不大量使用化肥，从而导致土壤结构的改变，土质的恶化以及环境(主要是水)的污染。
3.不可预料的效应
食用转基因食物，有可能使被转基因DNA侵入人体细胞，产生病原病毒。同时，转基因DNA有可能插入人体细胞的基因组，而由于插入位点的随机性，可能造成有害和致死效应，包括癌症。
