小龙虾体内含有大量细菌和寄生虫，食用的时候一定要煮熟，小龙虾的头部、肠道、虾子等部位的寄生虫最多，最好不要食用。
1、小龙虾的头部是吸收并处理毒素最多的地方，也是最易积聚病原菌和寄生虫的部分。小龙虾的虾头部分千万不能食用。更不能生吃，严重的会导致肺吸虫病。
2、小龙虾的肠道等消化系统，往往容易聚集重金属，烹饪前应把虾线拉出来。
3、在搞不清楚虾子干净与否的情况下，虾黄要少吃，最好不吃。虾黄是龙虾的性腺，与肝脏挨一起，也容易受到污染。
因为小龙虾中含有寄生虫，所以制作小龙虾时，一定要高温加热。温度一定要达到100摄氏度以上，至少持续5分钟以上，另外，食用前的清洗很重要，一定要用刷子洗净小龙虾身体上的脏物，同时隐藏了大量泥沙和细菌的肠线也必须剔除干净。有些大排档、饭店等餐饮商家会讲究口感鲜嫩，用爆炒等方式制作，这样很可能出现熟不透的状况。可以通过观察虾仁横截面颜色是否一致来判断是否煮熟，如果吃了未煮熟的虾，容易感染肺吸虫病和导致胃肠道中毒。
此外，在食用小龙虾时，尽量选用活虾进行烹调食用，因为小龙虾死后会很快腐烂，会分解产生组胺等有毒物质，滋生有害病菌。
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