长期大量的使用农药，对土壤、大气、水体的污染是很严重的，已经引起了人们的广泛关注。农药污染土壤的主要途径：一是施用于田间的各种农药大部分落入土壤中，附着于植物体上的部分农药因风吹雨淋落入土壤中;二是使用浸种、拌种等施药方式，或是将农药直接撒于土壤中，造成污染的累积;三是近年来采用喷射方法(如飞机喷射)使用农药，估计有50%以上的农药从叶面落入土壤，也有大量的农药撒在或蒸发到空气中，一旦降雨，随雨水降落到土壤中，污染土壤。那么土壤中有农药残留怎么办呢?
首先可以通过深翻换土将被污染的表层土壤深翻到底层，让未被污染的底层土壤翻上来，来改变可耕作土壤的栽培环境。
再就是农药残留可以通过生物降解和非生物降解两种方式被清除。在动植物体内或微生物体内外的降解作用属生物降解。增施有机肥，提高土壤蓄水蓄肥能力，为土壤微生物提供良好的生存环境，从而提高土壤的自净能力。微生物修复是污染土壤中人工接种能降解农药的微生物，利用微生物将残存于土壤中的农药降解或去除，使其转化为无害物质或降解成CO2和水的方法。近几年植物修复技术逐渐成为生物修复中的一个研究热点，培养出各种转基因植物，让它们吸收土壤中的有害物质。植物修复适用于大面积、低浓度污染，不但可去除环境中的农药，还可去除环境中重金属与放射性元素。
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