生态旅游的根本宗旨是旅游经济与环境保护的协调发展，从永续发展的观点来看，生态旅游对环境的正面效益是十分明显的。
根据国家级风景区质量等级标准规定，其区域大气环境质量和水环境质量都应该是I级或者II级。这一标准促使各个风景区对大气环境极力进行保护，对大气污染进行治理。下面举例说明：
1.黄山市汤口镇寨西村，在开发生态旅游之前，家家都砍木烧炭，砍柴煮饭，每年破坏树木35万-40万千克，既造成了黄山森林资源的破坏和空气的污染。开展生态旅游以后，他们意识到保护大气质量的重要性，家家户户自觉地改善了能源结构，改用液化气，使大气污染状况得以好转。
2.湖南张家界过去空气中二氧化硫含量高达0.62mg/m,超过了国家I级大气标准3.68倍， PH值达4.44，开展生态旅游以后，规定了排污标准。在促进水体保护和水体污染的治理方面，有明显的效果。许多风景名胜区山清水秀，水体洁净，优于周围其他地域的水体环境。
3.昆明滇池由于多年国家级风景名胜区和旅游度假区的经历，使水质污染严重，构成负面影响，成为旅游开发的限制因素。为开展生态旅游，昆明市在滇池畔兴建了几座污水处理厂，彻底整治了大观河等几座入湖河流，将草海与外湖隔离开来，开通西园隧道，清理草海等，总共耗资160多亿元，大大提高了滇池水体质量。
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