药物性医疗垃圾是指过期、淘汰、变质或者被污染的废弃的药品，由于药物性医疗垃圾会对环境造成污染，因此不能随意处置，应该按药物性废物处理，交医疗废物处理站处理。
药物性医疗垃圾分类：
1. 废弃的一般性药品，如：抗生素、非处方类药品等。
2. 废弃的细胞毒性药物和遗传毒性药物，包括：
a) 致癌性药物，如硫唑嘌呤、苯丁酸氮芥、萘氮芥、环孢霉素、环磷酰胺、苯丙胺酸氮芥、司莫司汀、三苯氧氨、硫替派等;
b) 可疑致癌性药物，如：顺铂、丝裂霉素、阿霉素、苯巴比妥等;
c) 免疫抑制剂。
3. 废弃的疫苗、血液制品等。
用于处理医疗垃圾已有多种技术，根据处理原理不同，一般可分为灭菌消毒法、焚烧法、等离子体法、热解法和卫生填埋法等。
药物性医疗垃圾通常会采用焚烧法进行处理
根据研究，医疗垃圾中占总重量92%的组分为可燃性成分，不可燃成分仅为8%，在一定温度和充足的氧气条件下，可以完全燃烧成灰烬。焚烧处理是一个深度氧化的化学过程，在高温火焰作用下，焚烧设备内的医疗垃圾经过烘干、引燃、焚烧三个阶段将其转化成残渣和气体，病原微生物和有害物质在焚烧过程中也因高温而被有效破坏，还能有效实现减容和减重。
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