婚姻关系不会自动解除。因感情不和分居满两年只是准许离婚的一个条件，只要能够证明因感情不和分居满两年的，法院就应当判决离婚。离婚只有两个途径：
1、登记离婚：如果双方都同意离婚，并且对夫妻共同财产的分割及子女抚养问题达成一致意见的，可以由婚姻登记机关发给离婚证。
2、如果双方在离婚、夫妻共同财产分割、子女抚养三个问题中有一个问题不能达成一致意见的，则需由法院判决能否离婚。
二、我国《婚姻法》关于离婚的相关规定主要有：
第三十一条 男女双方自愿离婚的，准予离婚。双方必须到婚姻登记机关申请离婚。婚姻登记机关查明双方确实是自愿并对子女和财产问题已有适当处理时，发给离婚证。
第三十二条 男女一方要求离婚的，可由有关部门进行调解或直接向人民法院提出离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解;如感情确已破裂，调解无效，应准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应准予离婚：
(一)重婚或有配偶者与他人同居的;
(二)实施家庭暴力或虐待、遗弃家庭成员的;
(三)有赌博、吸毒等恶习屡教不改的;
(四)因感情不和分居满二年的;
(五)其他导致夫妻感情破裂的情形。
第三十三条 现役军人的配偶要求离婚，须得军人同意，但军人一方有重大过错的除外。
第三十四条 女方在怀孕期间、分娩后一年内或中止妊娠后六个月内，男方不得提出离婚。女方提出离婚的，或人民法院认为确有必要受理男方离婚请求的，不在此限。
第三十五条 离婚后，男女双方自愿恢复夫妻关系的，必须到婚姻登记机关进行复婚登记。
三、夫妻分居有两种类型：
第一种是因客观原因造成的，如夫妻俩分别在两个城市工作，没有同居的条件，这种夫妻分居的情形，不是因感情不和而分居，即是夫妻分居时间满两年也不符合“因感情不和分居”的法定提出离婚的理由。
第二种是主观原因造成的，如婚姻基础不牢固，婚后没有培养起夫妻感情而分居满两年的，符合“因感情不和分居”的法定离婚的理由。
分居时间应连续计算。因关于分居的举证比较困难，一般要双方共同认可。分居两年并不能自动离婚，它只是判断离婚的一个因素，离婚只有通过民政部门登记或者法院诉讼离婚才可以解除婚姻关系。
综合上面所说的，在婚姻法里如果想要离婚那么就必须要提交合法的材料到相关的部门进行办理才能办理离婚证，在我国的法律上不管是分居多久都不能自动离婚的，所以，一切还都得按照合法的程序来这样才能更好的办理好所有的事情。
